罗布泊糖霉菌属放线菌系统进化分析
2014-03-21韩晓雪吕玲玲罗晓霞张利莉
韩晓雪 吕玲玲 罗晓霞 张利莉
(塔里木大学生命科学学院/新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室, 新疆 阿拉尔 843300)
罗布泊位于新疆塔里木盆地东部,曾是我国第二大内陆湖,现已干涸。罗布泊地区常年干旱,日照强度强,昼夜温差大,夏季气温高达71 ℃,为一望无际的戈壁滩,被视为“生命禁区[1]”。2012年,关统伟对罗布泊地区土壤放线菌非培养和可培养多样性进行了研究。可培养发现18个属的放线菌,其中放线多孢菌属(Actinopolyspora)是罗布泊盐湖中纯培养的优势类群,并且发现8个新物种;非培养结果发现,糖霉菌属(Glycomyces)为罗布泊地区优势菌群,打破了人们对环境中链霉菌为放线菌优势菌群的常规认识[2]。
Glycomyces为糖霉菌科(Glycomycetaceae)典型属,1997年由Stackebrandt等人根据16S rRNA序列相似性提出[3],是糖霉菌科中最大的一个属,包括11个有效发表的种,Glycomycesharbinensis作为该科的模式种[4]。Glycomyces放线菌均分离自植物或土壤,除Glycomyceshalotolerans分离自极端特殊环境,可耐受10%盐浓度外,其余种都分离自普通环境[4-10]。迄今为止,罗布泊Glycomyces多样性的研究鲜有报道。本研究以新疆罗布泊地区土壤样品为材料,使用5种培养基,共分离到7株Glycomyces放线菌,将分离得到的Glycomyces放线菌菌株通过16S rDNA测序,利用系统发育分析,以期揭示罗布泊土壤Glycomyces放线菌的多样性,为开发利用这一类微生物资源提供理论基础和菌种支持。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样品来源及处理
2010年从新疆罗布泊采集土壤样品。样品采集后装于无菌的自封袋中,运抵实验室后保存在-20℃冰箱中。
土壤样品自然风干,称取2 g土壤样品放入18 mL的无菌15. 06% NaCl溶液中,加入无菌玻璃珠,37℃充分振荡1 h,制成10-1悬浊液。……
