王玲慧等

摘 要：采集杨凌五泉、揉谷和李台3个番茄主产区表现矮化、黄化及曲叶症状的植株嫩叶，克隆番茄黄化曲叶病毒（TYLCV）基因全长并测序，依次得到病毒分离物TYLCV-SXYL2、TYLCV-SXYL3和TYLCV-SXYL4。通过多序列比对、系统发育树构建及蛋白质结构和理化性质预测等生物信息学方法进行基因组和蛋白质的特征分析，结果表明，杨凌区3个TYLCV分离物之间全长核苷酸相似度为99.3%～99.4%，是不伴随卫星分子的单组分病毒，属TYLCV-IS株系的不同分离物，全长为2 781 nt；与山东寿光病毒分离物TYLCV-SDSG亲缘关系最近，相似度为99.6%，与陕西泾阳的分离物TYLCV-SX8相似度为99.1%，与以色列株系TYLCV-IS相似度达97.7%～97.8%；编码6个蛋白质，其中CP、Rep、REn为跨膜蛋白，V2、TrAP、C4为胞内蛋白，Rep和REn为稳定蛋白，CP、V2、TrAP、C4为不稳定蛋白。

关键词：番茄黄化曲叶病毒；杨凌；番茄；生物信息学分析

中图分类号：S436.412.1+1 文献标识码：A 文章编号：1001-3547（2014）04-0054-07

番茄（Solanum lycopersicum L.）是世界上最重要的蔬菜作物之一[1]，而番茄黄化曲叶病（Tomato

yellow leaf curl disease，TYLCD）为全球番茄生产中最具威胁的“植物癌症”[2]，1961年以色列最先鉴定的番茄黄化曲叶病毒（Tomato yellow leaf curl virus，TYLCV）是其主要病原。TYLCV为单链环状DNA病毒，属于双生病毒科（Geminiviridea）菜豆金色花叶病毒属（Begomovirus），由烟粉虱（Bemisia tabaci）以持久性方式传播[3，4]，在寄主细胞核内形成的双链DNA复制中间体共编码6个开放阅读框。杨凌区是我国唯一的农业高新技术产业示范区，位于陕西省关中平原中部，2011年杨凌暴发的TYLCD已成为限制杨凌区番茄生产的主要因素，但目前未见有杨凌TYLCV全基因组分子特征及编码蛋白生物信息学分析的研究报道。本试验对杨凌区五泉、揉谷和李台的番……