生物信息学导论课程与进阶课程比较
2013-10-12孙志强宫二玲谢红卫
电气电子教学学报 2013年6期
刘 伟,孙志强,宫二玲,谢红卫
(国防科技大学机电工程与自动化学院,湖南长沙410073)
生物信息学是指综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解生物数据所包含的生物学意义的一门新兴的交叉学科,它涉及到生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和解释等各个方面,具有综合性、前沿性和应用性强的特点[1]。因此,生物信息学相关课程的开设具有较大的难度。
目前,国内外多所高校开设了生物信息学的相关课程。按照授课对象和授课目的的不同,生物信息学的相关课程可以分为导论课程和进阶课程两大类。这两大类课程的教学实施过程存在一定的区别,同时也有一些共同的特点。本文综合国内外高校的课程设置,结合我校实际教学经验,详细讨论这两大类课程和进阶课程的异同,提出了有针对性的课程内容安排和教学方法。
1 国内外生物信息课程设置情况
国内外已有多所高校开设了生物信息学的相关课程,如北京大学的“生物信息学导论”、中国科技大学的“生物信息学”、中国科学院的“生物信息学与系统生物学”和美国麻省理工大学的“Bioinformatics and Proteomics”等。表1给出了国内部分大学生物信息学课程设置的概况。
通过分析和比较国内外多所高校相关课程的设置,可以发现它们有一些相通之处,如都要体现生物信息学作为交叉学科的特点,都要以生物学问题为依托建立数学模型并应用相关算法。然而,各个课程的授课对象和授课重点又不尽相同,如有面向多个专业本科生开设的导论课程,也有面向生物学相关专业研究生开设的进阶课程,有的侧重于生物学工具使用和算法介绍,有的则侧重于生物学本身的问题描述和解决过程。……
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