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RUNX3基因rs2236852多态性与胃癌的关系*

2013-09-07鞠亚菲隋牮箐宋明全姜相君

胃肠病学 2013年8期
关键词:多态性基因型基因组

鞠亚菲 隋牮箐 宋明全 姜相君#

青岛大学医学院1(266000) 青岛大学医学院附属青岛市市立医院消化内二科2

胃癌是严重威胁人类健康的常见消化道肿瘤,近年其发病率呈逐渐下降的趋势,但仍是目前第4常见的恶性肿瘤,且死亡率位居所有恶性肿瘤的第二位[1]。我国是胃癌的高发区[2],发病年龄以中老年居多[3]。目前胃癌的病因尚未完全阐明,涉及多种因素及其相互的作用。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是人类基因组DNA序列可遗传变异的主要形式之一,可决定人类疾病的易感性,目前已被广泛用于疾病病因探索、治疗研究、预后评估等反映个体间易感性差异的研究。Runt相关转录因子3(Runt-related transcription factor 3,RUNX3)是近年新发现的肿瘤抑制基因,其基因多态性与亚洲人群胃癌的发生可能相关。本研究通过采用DNA直接测序法检测RUNX3基因rs2236852位点的基因型,旨在探讨该位点多态性与中国汉族人群胃癌发病的关系,以期初步了解rs2236852多态性与我国胃癌发病的关系。

对象与方法

一、研究对象

选取2011年3月~2013年4月青岛大学医学院附属青岛市市立医院确诊的310例胃癌住院患者,并排除有胃部疾病以及肿瘤家族史者。同时从青岛市市立医院体检中心选取同期327名健康体检者作为对照组。标本采集均获得研究对象的知情同意,本研究方案经青岛大学医学院伦理委员会审批通过。

二、研究方法

1.基因组DNA提取:取EDTA抗凝静脉血2 mL,采用血液基因组DNA提取试剂盒(离心柱型)[天根生化科技(北京)有限公司]提取基因组DNA,紫外分光光度计测定DNA浓度,-20℃冰箱保存。

2.聚合酶链反应(PCR)法:以RUNX3基因组序列为依据,设计该基因rs2236852位点PCR引物,由Invitrogen公司提供。引物上游序列:5’-GAG GTG GCA GCC CTG CCA TA-3’,下游:5’-TGG AGT GGC TCC CCT CTT TCT G-3’,片段大小120 bp。PCR 反应体系为 25 μL,含 100 μg/L DNA 模板,10 × PCR 缓冲液 2.5 μL,50 mmol/L MgCl20.8 μL,10 mmol/L dNTP 混合液0.5 μL,5 μmol/L 正反向引物各 1 μL,Platinum®Taq DNA 聚合酶(Invitrogen公司)0.2 μL,加入灭菌蒸馏水补足至25 μL。上ABI9700 PCR仪(美国 ABI公司)进行扩增反应,反应条件:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸30 s,共35个循环;72℃终延伸5 min。取PCR产物2 μL行2%琼脂糖凝胶电泳鉴定扩增产物。

3.DNA直接测序分析基因型:确定目的片段扩增成功后,加入POP-6胶,应用ABI PRISMTM3700 DNA Analyzer进行测序。

三、统计学分析

应用SPSS 13.0统计软件,所得数据以百分率表示。基因型频率先行Hardy-Weinberg遗传平衡检验,组间比较采用χ2检验,rs2236852位点基因型与胃癌发病风险关系的分析采用Logistic回归分析,计算OR值及其95%CI。P<0.05为差异有统计学意义。

结 果

一、一般资料

在研究期间纳入的310例胃癌患者中,男206例,女104例,平均年龄(55.7±14.2)岁。327名对照者中,男219名,女108名,平均年龄(56.4±14.6)岁。两组间性别构成(P=0.889)、年龄(P=0.891)、吸烟状况(P=0.055)和饮酒状况(P=0.627)相比差异均无统计学意义,说明样本具有可比性。

二、rs2236852位点基因型

琼脂糖凝胶电泳结果表明RUNX3基因rs2236852位点PCR扩增产物与目的片段大小一致,扩增成功。

对照组测序结果表明RUNX3 rs2236852基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,表明样本具有群体代表性。该位点AA、GA、GG基因型测序结果见图1。

三、RUNX3 rs2236852基因型与胃癌发病风险的关系

胃癌组与对照组的RUNX3 rs2236852基因型分布频率相比差异有统计学意义(P<0.05)。与AA基因型相比,GG基因型能显著增加胃癌的发病风险(OR=2.46,95%CI:1.60~3.78),差异有统计学意义;AG基因型虽能提高胃癌的发病风险,但差异无统计学意义(OR=1.58,95%CI:0.99 ~2.54)(见表 1)。

图1 RUNX3 rs2236852位点各基因型测序图

表1 RUNX3基因rs2236852位点基因型与胃癌发病风险的关系

讨 论

RUNX3位于染色体1p36.1,长约67 kb,含有 P1、P2两个启动子以及6个外显子,编码由415个氨基酸残基组成的核心结合因子(core binding factors,CBFs)。RUNX3蛋白是由α、β两个亚单位构成的异二聚体,α亚单位含有一段由128个氨基酸组成的高度保守域Runt结构域(runt domain,RD),能特异性识别目的基因并与之结合[4]。RUNX3作为转化生长因子(TGF)信号转导通路中非常重要的调节因子,可与TGF途径成员共同调控细胞的生长、发育和凋亡[5]。RUNX3基因遗传变异与肿瘤的研究目前较少见。Zhang等[6]的研究发现RUNX3基因rs2236852位点GG基因型能显著增加膀胱癌的发病风险。

RUNX3基因多态性与胃癌发生关系的研究结论目前未取得统一。Hishida等[7]报道了 RUNX3基因外显子 1 rs6672420位点和内含子rs760805位点T/A多态性与日本胃癌患者的关系,结果显示幽门螺杆菌感染者中,与TT基因型相比,rs760805位点携带A等位基因(TA、AA、TA+AA基因型)可明显促进胃萎缩的发生(调整OR值分别为1.51、1.59和1.53),但两个位点的多态性均与胃癌无明显关系。胡胜等[8]的研究发现RUNX3基因C364T突变与胃癌发生无关。Keller等[9]的研究分析了RUNX3基因多态性与34例德国家族性胃癌患者(20例弥散型,9例肠化生型和5例混合型)遗传倾向的关系,但未发现两者相关。Wu等[10]对RUNX3 10个标签SNPs与我国胃癌发生风险的关系进行了分析,发现3个标签SNPs的携带与胃癌风险增高有关,分别为SNP3 rs11249206 CC基因型(与TT基因型相比,调整OR=1.75,95%CI:1.03 ~ 2.99)、SNP7 rs760805 AA 基因型(与 TT 基因型相比,调整 OR=1.82,95%CI:1.14 ~2.92)、SPN8 rs2236852 GG基因型(与AA基因型相比,调整OR=1.69,95%CI:1.05 ~ 2.72)。本研究发现,胃癌组 RUNX3 rs2236852基因型分布频率与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05)。与AA基因型相比,GG基因型能显著增加胃癌的发病风险(OR=2.46,95%CI:1.60 ~3.78);AG 基因型可增加胃癌发病风险,但差异无统计学意义(OR=1.58,95%CI:0.99 ~2.54)。

综上所述,本研究结果初步显示RUNX3基因rs2236852位点GG基因型可能与中国汉族人群的胃癌发病风险增加有关,但该结论尚需今后行更大样本、设计更严格的多中心研究进一步验证。

1 Crew KD,Neugut AI.Epidemiology of gastric cancer[J].World J Gastroenterol,2006,12(3):354-362.

2 Yang L.Incidence and mortality of gastric cancer in China[J].World J Gastroenterol,2006,12(1):17-20.

3 谢英标主编.胃癌防与治[M].西安:西安交通大学出版社,2010:9-11.

4 Bangsow C,Rubins N,Glusman G,et al.The RUNX3 gene--sequence,structure and regulated expression[J].Gene,2001,279(2):221-232.

5 Derynck R,Akhurst RJ,Balmain A.TGF-beta signaling in tumor suppression and cancer progression[J].Nat Genet,2001,29(2):117-129.

6 Zhang Z,Wang S,Wang M,et al.Genetic variants in RUNX3 and risk of bladder cancer:a haplotype-based analysis[J].Carcinogenesis,2008,29(10):1973-1978.

7 Hishida A,Matsuo K,Goto Y,et al.Significant association of RUNX3 T/A polymorphism at intron 3(rs760805)with the risk of gastric atrophy in Helicobacter pylori seropositive Japanese[J]. JGastroenterol, 2009, 44 (12):1165-1171.

8 胡胜,宋启斌,柯玉华,等.RUNX3基因364位点C→T突变与胃癌关系的研究[J].中国病理生理杂志,2005,21(10):1905-1908.

9 Keller G,Vogelsang H,Becker I,et al.Germline mutations of the E-cadherin(CDH1)and TP53 genes,rather than of RUNX3 and HPP1,contribute to genetic predisposition in German gastric cancer patients[J].J Med Genet,2004,41(6):e89.

10 Wu D,Tian Y,Gong W,et al.Genetic variants in the Runt-related transcription factor 3 gene contribute to gastric cancer risk in a Chinese population[J].Cancer Sci,2009,100(9):1688-1694.

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