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2012-2013年福建省猪流行性腹泻流行病学调查

2013-08-08林裕胜王隆柏吴学敏周伦江邵良平

福建畜牧兽医 2013年6期
关键词:病料流行性毒株

林裕胜 王隆柏 吴学敏 周伦江* 邵良平

(1.福建农林大学动物科学学院 福州 350002;2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福州 350013)

猪流行性腹泻(Porcine Epidemic Diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine Epidemic Diarrhea Virus,PEDV)引起的猪的一种急性、高度接触性肠道传染病,发生于各种年龄猪,其中对哺乳仔猪的危害最为严重,以腹泻、呕吐和脱水为临床特征。1978年英国首次报道PED,并确定为一种冠状病毒引起的疾病[1]。在之后2年,Debouck P等在许多国家和地区对该病进行了血清学调查,结果都检测到PEDV 特异性抗体的存在[2]。我国于1980年首次分离到PEDV,以后许多地区均有PED 发生的报道,且流行范围逐渐扩大。崔现兰等对26个省、市、自治区的调查表明,因PED 导致的猪死亡率占36 种猪病总死亡率的1.74%,同时PED 与TGE的混感率近年已上升至30.77%[3]。2011年甘海霞等应用RT-PCR 对来自广东省34个县144个不同规模猪场的216 份临床猪粪样的检测结果表明,很多猪场普遍存在TGEV和PEDV,尤其以PEDV 感染更为严重,阳性率达27.8%[4]。为了进一步弄清福建省PEDV的分布和感染情况,2012-2013年上半年笔者对采自福建省62个规模猪场128 份发生腹泻的病料进行了PEDV 病原学检测,研究分析PEDV在猪群中的感染及流行规律,为猪流行性腹泻的防治提供科学依据。

1 材料和方法

1.1 材料

1.1.1 组织样品 2012-2013年上半年采集福建省9个地级市62个规模猪场的腹泻样品128 份,样品组织经剪碎、研磨,按1︰10 比例加TE 液稀释,-70 ℃保存备用。

1.1.2 主要试剂 病毒RNA 提取试剂盒购置OMEGA 公司,病毒DNA 提取试剂盒购自ROCHE公司,PCR 扩增试剂盒购置北京全式金生物科技有限公司,AMV 酶、dNTP和DNA Marker-2000 购自TaKaRa 公司。

1.2 方法

1.2.1 引物设计与合成 参照GenBank 中已发表的PEDV、TGEV、PROV的基因序列,设计合成检测引物。PEDV的检测引物,Up-5’-ATGTCTAACGGTTCTATTCCCGTTG-3’,Down-5’-TTAGACTAAA TGAAGCACTTTCTCA-3’,预期片段为563 bp;TGE V 检测引物,UP-5’-CTTCTAAATGGCCAACCAGGG AC-3’,Down-5’-CGAGCATCTCGTTTAGTTCGTT-3’,预期片段为1 168 bp;PROV 检测引物,Up-5’-GTATGGTATTGAATATACCAC-3′,Down-5’-GATC CTGTTGGCCATCC -3’,预期片段为342 bp;其他病毒引物参考文献[5]进行设计合成。引物由宝生物工程(大连)有限公司合成。

1.2.2 核酸提取 采用病毒RNA/DNA 提取试剂盒,参照操作说明,分别提取组织样品的总RNA/D NA,-70 ℃保存备用。

1.3 RT-PCR 或PCR 病原检测 采用北京全式金生物科技有限公司RT-PCR 扩增试剂盒,按照试剂盒提供的操作手册配制反应体系,RT-PCR 反应体系:Total RNA 4μL、5×TransScriptTM All-in-One SuperMix for PCR 4μL、Rnase-free Water 12μL,反应条件:25 ℃10 min,42 ℃30 min,85 ℃5 min。

PCR 反 应 体 系:2×GoTaq Master Green Mix 12.5μL,上下游引物各0.5μL,cDNA 或DNA 模版3μL,无菌去离子水8.5μL,混匀后进行扩增,条件为:95 ℃预变性5 min,95 ℃变性30 s,53~61℃复性30 s,72 ℃延伸30 s,35个循环;72 ℃终延伸5 min。取7μL 进行1%琼脂糖凝胶电泳,观察结果。

1.4 PEDVORF3和M 基因遗传进化分析 选取3个猪群发病严重的规模猪场采集的阳性PEDV 病料,扩增其ORF3和M 基因,将目的片段送生工生物工程(上海)有限公司进行测序,采用DNAstar 软件进行遗传进化分析。

2 结果与分析

2.1 PEDV 检测结果 对2012年至2013年上半年福建省各县市采集的128 份腹泻病料进行PEDV、TGEV、PROV、CSFV、PRRSV和PRV 检测。结果显示:PEDV的阳性率为67.97%(87/128),其中PEDV和TGEV 混合感染为19.53%(25/128),PEDV和PROV 混合感染为3.91%(5/128),PEDV和PRV 混合感染为14.84%(19/128),PEDV 与PRRSV 混合感染为6.25%(8/128)。见表1,部分电泳图见图1。

表1 PEDV 检测情况表

图1 PEDV 检测电泳图

2.2 PEDV ORF3和M 基因遗传进化分析 分别对发病严重的猪场采集的阳性病料进行了PEDV ORF3和M 基因扩增,均能扩增出目的片段。将阳性产物进行序列测序,获得了3 株PEDV,命名为FJFZ、FJPT和FJ YX 毒株。通过软件分析表明:3 株PEDV 在ORF3 基因划分成2个主分支,其中FJFZ毒株与韩国毒株、中国大陆毒株处于一大分支,FJPT 毒株单独于另一分支,FJ YX 单独处于一大分支,与attenuate DR13 弱毒株和致弱的CV777truncated 毒株的亲缘关系较远(见图2)。3 株M 基因中以FJFZ 毒株和FJPT 毒株与CV777 标准毒株处于同于小分支,亲缘关系较近,而FJYX 毒株单独处于一大分支(见图3)。

图2 4 株PEDVORF3 基因核苷酸遗传进化树

图3 4 株PEDV M 基因核苷酸遗传进化树

3 讨论

1)2010年下半年以来,猪流行性腹泻病毒造成了我国大量的小猪死亡,特别是对于饲养管理等条件不良的猪场,往往造成哺乳仔猪大量脱水、死亡。因此,该病成为严重影响我国养猪业健康的重要疫病之一。本次调查采集仔猪腹泻病料的样品,PEDV检出阳性率高达60.8%,而且存在PEDV 与TGEV、PEDV 与PROV、PEDV 与PRV、PEDV 与PRRSV 混合感染,与临近省市相比,福建省的PEDV 疫情相对严重,应该引起养殖场的重视。

2)鉴于近年来PED 发病严重,能导致90%以上的发病哺乳仔猪死亡,而且具有防控难的特点,多数从业人员怀疑流行毒株是否发生了遗传变异。因此,笔者分别从3个发生严重腹泻的猪场采集了3 份病料进行ORF3和M 基因序列测定,核苷酸遗传进化树分析表明,3 株PEDV 毒株的ORF3 基因和M 基因均存在基因突变,其中FJ YX 毒株与CV777 亲缘关系较远,M 基因片段与CV777和泰国流行毒株的亲缘关系较远。

[1]Pensaert M B,Debouck P.A New Coronavirus-like Particle Associated with Diarrhea in Swine[J].Arch.Virol,1978,58:237-243.

[2]Debouck P,Pensaert M.Experimental Infection of Pigs with a New Porcine Enteric Coronavirus,CV 777[J].Am J Vet Res,1980,41(2):219-223.

[3]崔现兰,马思奇,王明,等.应用免疫荧光法诊断猪流行性腹泻的研究[J].中国畜禽传染病,1990(5):20-24.

[4]甘海霞,梁晟,韦显凯,等.2011年广西猪群猪流行性腹泻和猪传染性胃肠炎调查[J].动物医学进展,2012,33(10):125-127.

[5]王隆柏,庄向生,周伦江,等.福建省规模猪场伪狂犬病流行病学调查与分析[J].中国畜牧兽医,2008,35(11):119-121.

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