松江鲈鱼野生群体遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化
2012-12-25刘至治潘连德唐文乔耿云皓
曾 珍, 刘至治, 潘连德, 唐文乔, 王 茜, 耿云皓
(上海海洋大学 省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306)
松江鲈鱼野生群体遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化
曾 珍, 刘至治*, 潘连德*, 唐文乔, 王 茜#, 耿云皓#
(上海海洋大学 省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海201306)
首先, 从294条10个碱基随机引物中, 筛选出32条多态性引物, 对富春江、黄河、滦河和鸭绿江等4个松江鲈鱼 (Trachidermus fasciatus)野生群体共120尾个体进行RAPD分析。结果表明, 松江鲈鱼野生群体的遗传多样性较丰富,其主要表现在:① 在扩增得到的591个位点中, 有515个(87.14%)位点呈现多态性,群体间多态位点比率(P)的大小顺序为:富春江群体89.17%>黄河群体87.99%>鸭绿江群体86.63%>滦河群体83.25%。② 松江鲈鱼群体间的Shannon信息指数(IT)和Nei’s遗传多样性指数(HT)分别在0.3393~0.3566和0.2157~0.2279间, 滦河群体的值较其他3群体稍低;若作为一个整体, 则总的 Shannon信息指数(IT)和Nei’s遗传多样性指数(HT)分别为0.3710±0.2153和0.2336±0.1643。③ 虽然群体间基因流值(Nm)在5.76103~19.84497间, 显示各地理群体间存在程度不同的基因交流, 但分子方差分析(AMOVA)结果却表明, 各群体间存在显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)的遗传分化。④ 聚类分析表明, 鸭绿江群体首先与黄河群体聚为一支, 再与富春江群体相聚, 最后与单独一支的滦河群体聚类, 表明鸭绿江、黄河、富春江等3群体间的遗传距离与彼此间的地理距离远近密切相关, 而滦河群体与它们的遗传距离较远。其次, 从获得的S1225525bp、S1225605bp、S1225841bp、S1345695bp、S1345825bp等5个特异RAPD条带中, 成功地由S1225605bp、S1225841bp条带分别转化出SCAR01560bp、SCAR02443bp的SCAR标记。这两个标记的出现频率, 在鸭绿江群体最高(96.67%和93.33%)、富春江群体其次(83.33%和90%)、黄河群体再其次(56.67%和66.67%)、滦河群体最低(13.33%和20%)。……
