框镜鲤维氏气单胞菌CY0806株鞭毛flaA基因的克隆与生物信息学分析
2012-11-10单晓枫吴同垒孟庆峰王伟利钱爱东
单晓枫,吴同垒,孟庆峰,王伟利,钱爱东
(1 吉林农业大学动物科学技术学院,吉林长春 130118;2 吉林出入境检验检疫局,吉林长春 130062)
维氏气单胞菌(Aeromonas veronii,AV)隶属于弧菌科气单胞菌属,是一种人-兽-鱼共患病原菌.其不仅在人抵抗力下降时,感染机体引发人的坏死性脑炎、败血症、腹泻等疾病[1-3];而且也可引发水生动物的疾病,给水产养殖业造成巨大损失[4-6].AV 有多种毒力因子,主要包括外毒素、蛋白酶、鞭毛、外膜蛋白等,其中,鞭毛作为大多数细菌的主要运动器官,在细菌致病性方面,起着举足轻重的作用.目前,国内AV的研究正处于起步阶段,本研究以框镜鲤Cyprinus carpio AV CY0806为研究对象,克隆其鞭毛flaA基因,并对其编码蛋白质进行了生物信息学分析,以期为框镜鲤AV的发病机理、基因工程疫苗等研究奠定基础.
1 材料与方法
1.1 菌株和载体
框镜鲤AV CY0806株分离自患病框镜鲤,为吉林农业大学预防兽医学研究室保存;大肠埃希菌Escherichia coli DH5α为吉林农业大学动物科学技术学院生物技术研究室保存;pMD18-T vector为宝生物工程(大连)有限公司产品.
1.2 主要试剂
Taq DNA聚合酶、dNTP均为宝生物工程(大连)有限公司产品;DNA凝胶回收试剂盒为爱思进生物技术有限公司产品;质粒小量抽提试剂盒为北京索莱宝科技有限公司产品;气单胞菌培养基RS为北京陆桥技术有限责任公司产品;其他试剂均为进口或国产分析纯.
1.3 引物设计与合成
根据GenBank上发表的AV鞭毛flaA基因序列,应用Primer Premer 5.0和Oligo 6.0软件设计1对引物:上游引物 P1:5'-GCGGAATTCATGGGCCTTTATATCA-3',下游引物 P2:5'-ACGAAGCTTTTAGCCTTGCCAACAGA-3',预计扩增片段长 915 bp,该引物由宝生……
