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胰腺导管腺癌microRNA表达谱的研究

2012-11-07张晶赵晨燕刘清华余党会陈颖史敏倪灿荣朱明华

中华胰腺病杂志 2012年5期
关键词:差异分析

张晶 赵晨燕 刘清华 余党会 陈颖 史敏 倪灿荣 朱明华

·论著·

胰腺导管腺癌microRNA表达谱的研究

张晶 赵晨燕 刘清华 余党会 陈颖 史敏 倪灿荣 朱明华

目的应用microRNA(miRNA)高通量生物芯片筛选胰腺导管腺癌及癌旁组织差异表达的miRNA,分析其相关的靶基因。方法收集9例新鲜的胰腺导管腺癌和3例癌旁组织,运用标记713个miRNA的Agilent miRNA生物芯片筛选胰腺导管腺癌差异表达的miRNA,应用荧光实时定量PCR方法验证表达上调的miRNA。采用TargetScan 5.1和miRandaV5分析软件分析差异表达miRNAs的靶基因。结果miRNA芯片筛选出11个胰腺导管腺癌相关的差异表达的miRNA,其中miR-194*、miR-192*、miR-602、miR-194表达上调,miR-139-3p、miR-513a-5p、miR-630、miR-30c-1*、miR-887、miR-508-5p、miR-516a-5p表达下调。miR-192、miR-194及其同源体的表达在31例胰腺癌组织中得到验证。经软件分析,miR-192靶基因有ZEB2、CXCL-2、EEF1A1、ERCC3,miR-192*靶基因有DCC、SMAD4、FAS,miR-194靶基因有DACH1、IGSF11、PTPN2、RBBP4,miR-194*靶基因有CD40LG、CIDEB、FHL1。结论胰腺导管腺癌存在11个表达差异的miRNA,这些miRNA可能与胰腺导管腺癌的发生、发展有关。

胰腺肿瘤; 微RNAs; 微阵列分析; 基因表达谱

MicroRNA(miRNA)是近年来发现的一类长度为19~23 nt的、广泛存在于动植物体内的、非编码单链RNA。miRNA通过作用于其靶mRNA,降解靶基因或抑制其翻译,发挥负调控作用。研究表明[1-6],miRNA参与生命过程中一系列的重要进程,包括早期发育、细胞增殖及分化、凋亡和免疫调节等,还具有癌基因和抑癌基因的作用。在不同类型的肿瘤中有其特异的miRNA表达谱。本研究采用miRNA芯片技术筛选胰腺导管腺癌与癌旁正常胰腺组织差异表达的miRNA,并分析其相关靶基因。

材料与方法

一、组织标本

收集2007年至2008年长海医院外科切除的9例胰腺癌组织标本及3例配对的癌旁正常胰腺标本送上海生物芯片有限公司行miRNA芯片检测,其中男性4例,女性5例,年龄47~75岁。……

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