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基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构

2012-10-23施兆鸿彭士明

海洋科学 2012年6期

孙 鹏, 尹 飞, 施兆鸿, 彭士明

(中国水产科学研究院 东海水产研究所, 农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室, 上海 200090)

基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构

孙 鹏, 尹 飞, 施兆鸿, 彭士明

(中国水产科学研究院 东海水产研究所, 农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室, 上海 200090)

利用线粒体细胞色素 c氧化酶Ⅰ亚基(COI)部分序列研究了南海区鲳属鱼类(Pampus)银鲳(P. argenteus)、珍鲳(P. minor)和中国鲳(P. chinensis)的系统进化与种群遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为643 bp的COI基因片段, 其A、T、G、C碱基的平均含量分别为25.4%、33.6%、18.9%和22.1%, A+T含量高于G+C含量。64条序列共定义了20种单倍型, 包含152个变异位点, 简约信息位点148个, 单变异位点4个, 产生169个点突变。结果表明, 银鲳与中国鲳的遗传差异最小, 银鲳与珍鲳的其次, 而珍鲳与中国鲳的遗传差异最大, 3种鲳属鱼类的遗传多样性均呈现较低的水平, 应采取有效的保护措施, 以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果为鲳属鱼类资源保护和合理开发利用提供必要的参考。

鲳属鱼类(Pampus); 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COI); 序列变异; 系统进化

鲳属(Pampus)鱼类属于硬骨鱼纲(Osteichthyes),鲈形目(Perciformes), 鲳科(Stromateidae), 为近海暖水性中下层鱼类。它广泛地分布于中国沿海、印度洋、太平洋沿岸, 由于其具有很高的营养价值和经济价值, 深受消费者青睐, 是中国沿海重要的经济鱼类[1]。过去, 中国分类学家曾将中国海区的鲳属鱼类分成3类[2-3], 即银鲳(P. argenteus)、灰鲳(P. cinereus)和中国鲳(P. chinensis)。而刘静等[4-5]则建议将中国的鲳属鱼类分为5类, 即: 银鲳、灰鲳、中国鲳、珍鲳(P. minor)和翎鲳(P. punctatissimus)。……

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