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高粱BTx623幼苗多酚氧化酶Real-time PCR引物扩增效率的检测

2012-10-10蔡玉笑张志雯秦素平陈于和

河北科技师范学院学报 2012年3期
关键词:效率

蔡玉笑,张志雯,秦素平,陈于和

(河北科技师范学院生命科技学院,河北秦皇岛,066600)

实时荧光定量PCR(Real-time PCR)技术在检测基因表达中起到重要的作用,其检测结果灵敏性高,操作简便,已被广大科研人员所广泛应用[1,2]。但在具体操作过程中经常出现重复性不稳定的现象,这与引物的扩增效率有直接关系[3~6]。PPO包含2个铜离子保守结构域,由细胞核基因编码然后运输到质体中。PPO的活性部位主要在N-结构域,由酪氨酸修饰[7]。近年来,关于多酚氧化酶的生化特性和反应机理的报道很多[8]。在菌类中,人们报道了很多关于PPO抑制剂,及其在生物工程及生物技术中可能的临床应用[9,10]。另外,对于多酚氧化酶蛋白二级结构也有了新的研究,其结构酷似软体动物的血蓝蛋白[11]。同时,人们对多酚氧化酶活性和生物抗逆性也有了很深的认识,但在高粱幼苗中SbPPO的表达情况还不是很清楚,本试验对高粱BTx623幼苗中的SbPPO家族的表达模式进行了探索。

1 材料与方法

1.1 材料

挑选高粱品系BTx623籽粒大且饱满的种子,在室温下培养1周,提取总RNA,8种连有200~300 bp外源高粱多酚氧化酶基因的片段和一个Actin基因片段的pGEM-Teasy质粒作为模板,用每一质粒的特异引物进行扩增。

1.2 引物设计

利用软件Primer Premier 5在8个高粱籽粒多酚氧化酶基因和1个Actin基因的非保守区设计特异引物(表1)。

表1 特异引物

1.3 试剂

SYBR-Green购自Takara公司,Tripure购自罗氏公司,逆转录酶购自Promega公司。

1.4 质粒浓度稀释

将9种质粒分别先稀释到10-8ng/L。

分别各取2 μL质粒定容到20 μL,将质粒稀释到10-9ng/L。

同样的方法将9 种质粒分别稀释到 10-10,10-11,10-12ng/L。……

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