刘福利，王飞久，邵展茹

（1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室，山东 青岛100049，2.中国水产科学研究院 黄海水产研究所，山东 青岛，100049；3.中国科学院 海洋研究所，山东 青岛，266071）

遗传密码是联系基因核苷酸序列与蛋白质氨基酸序列的纽带，具有简并性特点，即多个同义密码子编码同一种氨基酸。如果没有任何选择压力和突变基因的偏倚，每个核苷酸位点上的核苷酸突变都是随机的，同义密码子出现的概率也是一样的。但研究表明，同义密码子非均衡使用的现象普遍存在，即某些密码子比其他同义密码子具有更高的使用频率，这些密码子被称为最优密码子，此现象称为密码子偏性。这种同义密码子使用的偏好性广泛存在于从原核到真核生物中，从单一物种基因组中的不同基因到不同物种的基因组中［1－2］。研究发现，影响密码子偏好性的因素有很多，如碱基组成的差异［3－4］、自然选择（体现在基因表达水平上）［5－6］、tRNA 丰度［7－9］、基因长度［10－11］、mRNA 二级结构［12］、蛋白结构、疏水性以及氨基酸保守性［13］等。研究基因组和基因的密码子使用特征，具有重要的理论意义和应用价值。

长囊水云（Ectocarpussiliculosus）隶属于褐藻门（Phaeophyta）褐子纲（Phaeosporeae）水云目（Ectocarpales）水云科（Ectocarpaceae）水云属（Ectocarpus）。藻体为异丝体，由单列细胞组成并分枝。生于潮间带岩石上或石沼中，或附生于其他藻体上。由于具有以下特征，长囊水云被法国科学家Peter等推荐为褐藻类研究的模式生物［14］：较小的藻体（数厘米）；较短的生活史，实验室培养条件下3个月内可完成其生活史；……