亚麻EST-SSR标记开发

2012-09-20郑东泽

东北农业大学学报 2012年4期

关键词：研究

苏钰，李明，姜硕，郑东泽

（东北农业大学农学院，哈尔滨 150030）

亚麻（Linum usitatissimum L.）作为一种优质的纤维作物和油料作物，在工农业领域具有重要的经济价值。近年来，分子标记技术在亚麻种质资源遗传多样性、分子标记辅助育种、异基因标记、染色体连锁图谱构建等研究方面得到广泛应用[1]，且主要是RAPD、AFLP和RFLP标记。与上述标记技术相比SSR标记具有多态性高、呈共显性遗传、数量丰富、易于用PCR检测和在基因组上分布均匀等优点[2]，基于EST开发的SSR标记由于源自编码区，可直接用于基因作图和基因发掘，并因其信息量大、通用性好、开发简单等优越性成为近年来分子标记研究热点。目前小麦[3]、水稻[4]、棉花[5]、大豆[6]等作物研究中开发出的EST-SSR标记已在遗传图谱构建、通用性与比较作图、遗传多样性分析、品种鉴别方面得到了广泛应用，而已报道的亚麻EST-SSR标记数目较少[7]，远不能满足研究需要。本研究利用从NCBI公共数据库下载的EST序列开发出65对EST-SSR引物，以期增加亚麻的可用EST-SSR标记数量，为EST-SSR标记技术在亚麻遗传育种的应用研究奠定基础。

1 材料与方法

1.1 试验材料及总DNA的提取

用于EST-SSR引物多态性研究的20份亚麻材料来自东北农业大学亚麻研究室（见表1）。所有材料播种于东北农业大学香坊实验实习基地，于苗期取幼嫩叶片洗净，存放于-70℃冰箱中，10 d后液氮研磨，采用改进后的CTAB法提取亚麻总DNA。MgCl2、dNTP、Taq酶及分子质量标准购自于天根生化科技有限公司。