牛甘露聚糖结合凝集素A基因糖基识别域生物信息学特征的研究*
2012-09-17李博文李明涛柏会文刘玉芬
李博文,李明涛,柏会文,刘玉芬
(哈尔滨师范大学)
0 引言
甘露聚糖结合凝集素(mannan-binding lectin,MBL),是由肝细胞合成并分泌入血的一种天然免疫因子,属C型凝集素(Ca2+依赖型)超家族,被认为是非免疫宿主体内最重要的一线抗感染免疫分子[1].MBL肽链有4个功能区域:一个富含半胱氨酸的N末端区、胶原样区(collagenlike region,CLR)、颈区和 C末端糖基识别域(carbohydrate-recognition domain,CRD).CRD是MBL的识别功能区,在Ca2+的参与下,CRD特异性地与多种细菌、病毒、恶性细胞表面具有的以甘露糖、N-乙酰葡糖胺、N-乙酰甘露糖胺、岩藻糖等糖类等为末端糖基的糖结构结合,通过CLR区而发挥效应[2].牛MBL作为机体的一种天然免疫因子,在牛的天然防御过程中发挥着重要的作用,但是目前对于该因子结构的研究资料较少,本研究将对该分子的CRD区进行分析,为牛MBL-A的分子应用提供铺垫.
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试验材料
新鲜牛肝脏组织
1.1.2 引物设计与合成
根据GenBank数据库中MBL-A的cDNA基因序列 (登录号:BC109674),采用 Primer Premier 5软件设计一对特异引物,引物序列为正向引物5’-AGAAGCTGTATGTGACCAATCG-3’,反向引物5’-CAGAGCAGCAGGGAGACACT-3’,委托上海生工生物工程有限公司合成.
1.1.3 主要试剂与工具酶
AMV第一链cDNA合成试剂盒、UNIQ-10柱式胶回收试剂盒;TaqDNA聚合酶、T4DNA连接酶、pMD18-T载体均购自上海生工生物工程有限公司.其它相关试剂均为国产分析纯.
1.2 方法
1.2.1 肝脏总RNA的提取
取牛新鲜肝脏组织0.5 g,用液氮迅速研磨成粉末状,加入 700μL SDS缓冲液,350μL Tris酚,350 μL 氯仿,100 μL β -巯基乙醇,用漩涡振荡器剧烈震荡 10 min,14000 rpm、4℃离心10 min.取上清,加入等体积酚∕氯仿,剧烈震荡5 min,14000rpm、4 ℃离心5 min,重复一次.取上清,加入等体积氯仿(氯仿∶异戊醇=24∶1),剧烈震荡5 min,14000 rpm、4℃离……
