成 云，张艳萍，李志杰，郑永胜，谭成章，刘长军

(中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 兽医生物技术国家重点实验室/禽传染病研究室，黑龙江哈尔滨 150001）

鸡马立克氏病病毒LMS分离株基因组重复区的测定及分析

成 云，张艳萍，李志杰，郑永胜，谭成章，刘长军*

(中国农业科学院哈尔滨兽医研究所 兽医生物技术国家重点实验室/禽传染病研究室，黑龙江哈尔滨 150001）

为分析鸡马立克氏病病毒(MDV）LMS分离株的分子遗传特性，本研究对该分离株基因组重复区(包括连接长重复区和短重复区的α样序列）进行了测定。LMS分离株基因组的长重复区为11 746 bp，α样序列为997 bp，短重复区为12 431 bp。在重复区内，预测存在43个ORF，与参考病毒株序列相比存在5个变异较大的ORF。重复区的遗传进化分析表明，LMS分离株与国内814株和欧洲pC12-130株亲缘关系较近。LMS分离株在短重复区潜伏相关转录本(LATs）编码序列的预测转录起始位点位置存在缺失；LMS分离株在α样序列内存在一个新的短重复序列。

鸡马立克氏病病毒；序列测定与分析；重复区；α样序列

鸡马立克氏病(Marek's Disease，MD）为鸡的一种淋巴细胞增生性疾病，呈世界范围内流行，给养禽业造成严重的经济损失，其病原为MD病毒(MDV）。MDV为双股DNA病毒，基因组由独特区和重复区组成。重复区包括长重复区和短重复区两部分。长重复区含有多个MDV致瘤基因，如meq、RLORF4和vIL8等。短重复区含有病毒即早期表达的基因ICP4，以及编码病毒潜伏相关转录本(Laten-cy-associated transcripts，LATs）序列[1]。此外，MDV microRNA的编码序列也定位在重复区内[2]。长重复区和短重复区由与病毒包装相关的α样序列连接。……