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正交设计优化山野豌豆SRAP-PCR反应体系与引物筛选

2012-08-20刘颖王显国张巨明刘芳

草业学报 2012年5期
关键词:体系优化

刘颖,王显国,张巨明*,刘芳

(1.华南农业大学农学院,广东 广州510642;2.中国农业大学动物科技学院,北京100193;3.全国畜牧总站,北京100193)

山野豌豆(Vicia amoena)又叫落豆秧、高蔓草藤、宿根苕子,为豆科巢菜属多年生草本植物[1]。它表现出耐寒、抗旱、叶量大、粗蛋白及动物必需氨基酸含量高、适应性广、再生力强、容易繁殖、产量高、品质好等优点[2-5]。另外,山野豌豆不仅是一种优良牧草,而且还是很好的防风固沙水保植物[6]、改土肥田绿肥作物[7]和草坪及药用植物[8],具有推广和应用价值。目前SRAP(sequence related amplified polymorphism)标记已在农作物和园艺作物上有了较多成功的应用,但SRAP在豆科牧草种质资源上的应用还非常少,仅在苜蓿(Medicago)[9-15]、大豆(Glycine)[16-18]、三叶草(Trifolium)[19,20]、山羊豆(Galege)[21]、小扁豆(Lens)[22,23]等属有相关报道。本研究主要采用正交设计法对SRAP-PCR反应条件中主要因子:Mg2+、dNTP、引物、Taq酶进行优化分析并确定了模板DNA浓度,旨在筛选出一个适用于野豌豆属的稳定性及重复性好,多态性高的最佳反应条件。此外,本研究还对部分SRAP引物组合进行了多态性筛选,希望获得一些多态性丰富的SRAP引物组合,为开展SRAP标记技术在山野豌豆种质鉴定、遗传多样性等方面的分子生物学研究提供有利依据。

1 材料与方法

1.1 供试材料

试验所用5份山野豌豆材料采自全国3个不同的地域,优化SRAP-PCR体系的DNA模板来自内蒙古呼伦贝尔的9号、山西五台山的6号及北京百花山的14号DNA;筛选引物所用DNA模板来自山西沁源的11号、北京灵山的5号及内蒙古呼伦贝尔的9号DNA。

1.2 试验设计与方法

1.2.1 PCR反应体系设计与引物组合 采用L9(34)正交试验设计,对 Mg2+、dNTP、引物、Taq DNA 聚合酶进行4因素3水平筛选(表1)。……

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