二连浩特站不断优化通关环境，加强与“一关两检”、站区铁路各联劳单位及蒙古国铁路部门的协调配合，大幅提升国际口岸联运效率。截至 2012 年 8 月 7 日，二连浩特站完成进出口运量544.94 万 t，同比增长 12.95%，其中进口运量同比增长 13.76%，出口运量同比增长 7.5%。

针对铁矿石等大宗白货品类货物进口量持续增长的实际，呼和浩特铁路局利用二连浩特站与扎门乌德站宽轨联络二线开通的优势，全面优化资源配置，对主型空车快速排空，最大限度地提高运输生产能力，实现宽轨敞口接运、准轨快速装运，在口岸安全畅通方面有了新突破。

二连浩特站主动与“一关两检”、蒙古国铁路部门加强沟通协调，对铁矿石等大宗货物实行“先放行、后报关报检”的预约式报关报检程序，有效缩短外国车辆停留时间。