BC1设计下标记密度对QTL定位精确性的影响
2012-06-09王鲜萍鲁绍雄
河南科技学院学报(自然科学版) 2012年1期
关键词:效应
王鲜萍,鲁绍雄
(1.河南大学生命科学学院,河南开封475001;2.云南农业大学动物科技学院,云南昆明650201)
BC1设计下标记密度对QTL定位精确性的影响
王鲜萍1,鲁绍雄2
(1.河南大学生命科学学院,河南开封475001;2.云南农业大学动物科技学院,云南昆明650201)
通过计算机模拟分析BC1设计中标记密度(标记间隔分别为5、10、20、50 cM)对数量性状基因座(QTL)定位精确性的影响,以均方误(MSE)为衡量指标.结果表明:当遗传图谱上相邻标记间的图距在5 cM以上时,提高标记密度,对于提高QTL定位的准确性和精确性具有积极的效应,但当标记密度达到某一程度(相邻标记间图距为2 cM)时,由于方法本身的局限,继续增加标记密度,对标记-QTL连锁分析法定位QTL的效果则没有实际意义,标记密度对检验统计量LOD值的影响不明显.
BC1设计;标记密度;QTL定位;最大似然法
家畜的大多数重要经济性状都是具有复杂遗传基础的数量性状(quantitative trait).传统数量遗传学的一系列理论和方法都是建立在微效多基因假说(minor-effect polygene hypothesis)的基础上,该假说认为数量性状是受大量的、效应微小而类似、并且可加的基因控制.这些基因在世代相传中服从孟德尔定律,即分离规律和自由组合规律,以及摩尔根的连锁互换规律.由于单个基因的效应很小,易受环境影响,因而无法确定单个基因的效应及其在染色体上的位置[1-2],更不能对其进行准确的识别、分离和克隆.但在近二、三十年来,大量的理论研究和试验结果表明,数量性状既受数目较多的微效基因(minor-effect gene)的影响……
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