长牡蛎基因组微卫星引物的开发和特性描述
2011-12-28韩斐斐亓海刚李莉张国范闫喜武李慧娟杨霏王琳楠
韩斐斐,亓海刚,李莉,张国范,闫喜武,李慧娟,杨霏,王琳楠
(1. 大连海洋大学,辽宁 大连 116023;2. 中国科学院海洋研究所,山东 青岛 266071)
长牡蛎基因组微卫星引物的开发和特性描述
韩斐斐1,2,亓海刚2,李莉2,张国范2,闫喜武1,李慧娟1,2,杨霏1,王琳楠1
(1. 大连海洋大学,辽宁 大连 116023;2. 中国科学院海洋研究所,山东 青岛 266071)
长牡蛎于20世纪80年代从日本引进中国。在我国,长牡蛎已经成为重要的贝类养殖产业之一。本实验从全基因组上筛查微卫星序列,在微卫星筛查的范围、数目和类型上是传统的富集文库法开发微卫星所无法比拟的。利用基因组微卫星序列总共设计了104对引物,54对引物能扩增出目的片段,其中有34对引物显示多态性扩增,占32.7%,20对引物显示单态性扩增,占19.2%。在自然群体48个个体样本中分析了这些位点的多态性,结果表明:等位基因数目在2~8之间,观测杂合度和期望杂合度分别在0.065 2~0.795 5和0.063 8 ~0.853 4之间。34对微卫星分子标记中有7对符合哈迪-温伯格平衡,27对或多或少的偏离平衡。微卫星分子标记可以用作分子遗传育种、遗传连锁图谱的构建、种群遗传结构的分析、亲缘关系分析等方面。
长牡蛎;微卫星;标记开发;基因组
长牡蛎(Crassostrea gigas)又称太平洋牡蛎,属于软体动物门,瓣鳃纲,翼形亚纲,珍珠贝目,牡蛎科,具有个体大、生长速度快、适应性强、成活率高等特点[1]。20世纪80年代初从日本引入我国,80年代末在我国北部沿海大面积养殖,是我国海产贝类养殖中规模大、产量高的养殖品种之一[2],也是世界上产量最高的养殖贝类品种之一[3]。……
