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应用Solexa技术检测脐血CD34+细胞体外诱导的巨核细胞mRNA表达

2011-12-01朱发明刘晋辉吕行军严力行

中国医学科学院学报 2011年5期
关键词:差异检测

王 芳,何 吉,朱发明,刘晋辉,秦 斐,陈 舒,徐 罡,吕行军,严力行

浙江省血液中心 血液安全研究卫生部重点实验室,杭州 310006

·论著·

应用Solexa技术检测脐血CD34+细胞体外诱导的巨核细胞mRNA表达

王 芳,何 吉,朱发明,刘晋辉,秦 斐,陈 舒,徐 罡,吕行军,严力行

浙江省血液中心 血液安全研究卫生部重点实验室,杭州 310006

目的应用Solexa技术研究人脐带血CD34+细胞体外诱导巨核细胞的mRNA表达。方法采用密度梯度离心法和免疫磁珠分选系统获取人脐带血CD34+细胞。100 ng/ml 促血小板生成素诱导培养12 d后,应用抗CD41+单克隆抗体免疫磁珠法分选获得巨核细胞和非巨核细胞。应用Solexa技术检测巨核细胞和非巨核细胞的mRNA表达差异。结果获取的Tag初始数量巨核细胞和非巨核细胞分别为 3 773 147 和 3 533 805 个。整个清晰的Tag数量分别为 3 291 132和 2 967 947 个,明显独特的tag数量分别为 197 769 和 245 318 个。其中上调基因表达数量为1161个,下调为902个。上调Tag表达数量为2717个,下调为1519个。结论巨核细胞和非巨核细胞 mRNA表达存在显著差异,差异基因编码产物与细胞发育、黏附、凋亡、代谢、细胞内及细胞间的信号转导以及免疫应答等功能相关,进一步深入将有助于探讨巨核细胞的表达机制、信号传导及调控机制。

巨核细胞;mRNA表达;体外扩增;Solexa测序

造血干细胞分化成巨核细胞进而产生血小板,涉及到巨核细胞系各期细胞的形成、血小板的入胞和出胞等,是一个复杂的过程,到目前为止其分子机制仍不明确。本研究采用人脐血干细胞体外促血小板生成素(thrombopoietin, TPO)诱导扩增分化为巨核细胞,应用Solexa测序技术检测巨核细胞和非巨核细胞的mRNA表达差异,探讨巨核细胞的表达机制、信号传导及调控机制。……

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