感染CDV的犬病料N、H、F基因的克隆与序列分析
2011-10-19刘巧荣包新奇乔明明陈曦秦亚嫚陈西钊
刘巧荣,包新奇,孙 明,王 芳,乔明明,李 佳,陈曦,秦亚嫚,陈西钊,2
(1.北京世纪元亨动物防疫技术有限公司,北京 100085;2.中国动物疫病预防控制中心,北京 100085;3.江苏省动物疫病预防控制中心,南京 210036)
感染CDV的犬病料N、H、F基因的克隆与序列分析
刘巧荣1,包新奇3,孙 明1,王 芳1,乔明明1,李 佳1,陈曦1,秦亚嫚1,陈西钊1,2
(1.北京世纪元亨动物防疫技术有限公司,北京 100085;2.中国动物疫病预防控制中心,北京 100085;3.江苏省动物疫病预防控制中心,南京 210036)
目的 了解病料中犬瘟热病毒(CDV)的变异情况,为犬瘟热的预防与治疗提供理论依据。方法 采用RT-PCR方法对犬病料中CDV的血凝素蛋白(H)、融合蛋白(F)和核衣壳蛋白(N)基因进行扩增,将扩增产物克隆到pGEM-T-easy载体中测序,并进行序列分析。结果 测定一株 CDV的 H、F和 N基因大小分别为1863 bp、1653 bp和2235 bp。同源性分析表明,未发现碱基的插入和缺失。该病毒的 H、F和 N基因分别与国内强毒株BJ080127株的H基因、GN株的F基因和HL株的N基因亲缘关系最近,氨基酸同源性分别为97.3%、97.7%和99.3%。与国外标准野毒株A75-17在核苷酸水平上同源性依次为94.4%、93.8%和97.2%,与疫苗株CDV3在核苷酸水平上同源性分别为88.5%、88.8%和93.9%。系统进化树表明该病毒与国内强毒株在同一谱系。糖基化分析显示,该病毒在F基因3~5位氨基酸处多出1个糖基化位点。结论 本研究从犬病料中成功克隆了犬瘟热病毒血凝素蛋白、融合蛋白和核衣壳蛋白,在F基因中新增了一个糖基化位点,为犬瘟热的遗传变异和流行学研究提供了分子生物学依据。
犬瘟热;血凝素蛋白基因;融合蛋白基因;核衣壳蛋白基因;序列分析S……p>
