赵 旭，刘向国，王爱荣，3

(1.福建农林大学生物农药重点实验室，福建 福州 350002;2.福州市园林科学研究院，福建 福州 350003;3.福建农林大学计算机与信息学院，福建 福州 350002)

DnaJ结构域是个非常保守的结构域，大约由70个氨基酸组成，其核心结构是组氨酸/脯氨酸/天冬氨酸(His/Pro/Asp，HPD)三肽[1]。含有DnaJ结构域的蛋白统称为DnaJ蛋白。DnaJ蛋白作为辅助蛋白通过激活热激蛋白70的ATP酶活性而调控其活性，在细胞内具有多种功能，包括新生蛋白的折叠、胞吞作用、多肽穿过细胞器质膜的转运、调整对各种胁迫的反应及对预降解蛋白的靶定等[2-4]。在大多数生物中都发现存在类似DnaJ的蛋白。目前，DnaJ蛋白分为三类[3]:第一类具有最早发现的DnaJ蛋白结构，含有4种结构域:N端的DnaJ结构域、富含甘氨酸和苯丙氨酸区域(G/F结构域)、含有4个Cys-X-X-Cys-XGly-X-Gly基序的富含半胱氨酸(CR)结构域和C末端结构域(CTD);第二类只有3种结构域，即:DnaJ结构域、G/F结构域和CTD结构域;第三类只有DnaJ结构域具有同源性，除了DnaJ结构域外，可能还含有其他各种结构域。

各种生物中的DnaJ蛋白数目不同，酵母中有22个[3]，人细胞中有41个[5]，拟南芥中至少有89个[6]。迄今，已有几个水稻DnaJ基因被分离并进行了功能鉴定[7-8]，但尚未见水稻中DnaJ蛋白的相关报道。本文对水稻DnaJ家族成员进行相关的生物信息学分析，以期更清晰地了解该类蛋白的结构、种类和功能。

1 材料与方法

1.1 数据库搜索

在水稻数据库(http://rice.plantbiology.msu.edu/analyses_search_domain.shtml)中输入 DnaJ或其Pfam 号(PF00226)进行搜索，再用 InterProScan(http://www.ebi.ac.uk/InterProScan/)和 Pfam(http://pfam.sanger.ac.uk/)对所获得的蛋白氨基酸序列进行结构域分析。将缺少DnaJ结构域及缺少保守的HPD的蛋白除去。……