基因芯片筛查外周血中胃癌转移相关基因
2011-08-13黄素英陈华田俊应敏刚郭福榕詹文青
中国实用医药 2011年30期
黄素英 陈华 田俊 应敏刚 郭福榕 詹文青
胃癌患者出现复发和(或)转移是影响胃癌患者生存期的重要因素。从分子水平探索胃癌转移机制,寻找理想的胃癌转移相关分子标志物,预测患者的预后情况,制定个体化治疗方案,是进一步提高胃癌患者生存率的有效途径。本文采用全基因组表达谱芯片技术,分析出现转移与未出现转移的胃癌患者以及健康者之间外周血基因表达谱的差异,筛选与胃癌转移相关的差异表达基因,并探讨其生物学意义。
1 资料与方法
1.1 样本收集 选择经临床和组织病理检查确诊为胃癌,未化疗且排除其他原发性肿瘤的胃癌患者10例,其中胃癌转移组5例(转移至肝脏),胃癌未转移组5例;另选择健康体检自愿者5例为对照组。经知情同意后,采集外周血5 ml,分离有核细胞,送上海康成生物工程有限公司进行phalanx人全基因组表达谱芯片(人32050个基因)检测。
1.2 胃癌转移相关基因筛选 筛选全基因组表达谱芯片获取的基因差异表达水平≥2,且经T-test统计分析显著差异表达的基因(P<0.05),判定为差异表达基因,采用Panther system分析与胃癌转移相关的阳性基因。
2 结果
根据在肿瘤转移过程中参与粘附、降解、移动的基因在上述不同组中的表达水平,在参与肿瘤转移过程的1541个基因中筛选出显著差异表达(表达量上调2倍或下调2倍)的阳性基因157个,其中,胃癌合并转移组与胃癌未转移组及健康对照组比较,有65个基因表达下调,92个基因表达上调。结果见表1和表2。……
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