多元主成分和动态聚类在油菜常规试验主要性状分析中的应用
2011-07-31万林生单忠德孙红芹倪正斌
浙江农业科学 2011年6期
万林生,单忠德,孙红芹,倪正斌
(江苏省沿海地区农业科学研究所,江苏 盐城 224002)
随着育种工作越来越精细化,传统育种依赖肉眼判断和唯一产量高低判断已经显示出越来越多的弊端。本研究通过将多元统计分析方法中的主成分分析和动态聚类分析联合分析,对多性状资料进行降维,通过线性组合,提炼出较少几个彼此独立的2~3个主成分,并对提炼出来的几个主成分进行动态聚类分析,将品种或者育种材料进行分类,从而选择与对照一类或者超越对照性状的几类进行进一步的研究。该研究打破了育种中仅以产量高低为唯一标准选择材料的传统,为传统育种的量化分析提供了一个新的思路。同时,采用聚类分析可以避免当选育品种数目较多时采用方差分析产量产生的自由度不单一的错误。研究并以2009-2010年江苏省常规油菜预备试验14个品种(含对照)为数据资料,阐明分析的具体过程。
1 材料与方法
1.1 主成分分析和动态聚类分析
主成分分析又称主分量分析,是指将原始的多个变量,通过线性组合,提炼出较少几个彼此独立的新变量的一种多元统计方法[1]。通常数学上的处理就是将原来p个指标作线性组合,成为新的综合指标,第1线性组合即第1个综合指标记作Y1,Y1的方差越大,包含的信息越多,方差最大的称作第1主成分,若Y1不足以代表原来p个指标的信息,则考虑第2主成分,即Y2,以此类推。主成分分析的作用:降低所研究的数据空间的维数,多维降为少维并用图形直观表示;便于解释,把所研究的性状串起来,我们可以得到产量主成分、形态性状主成分、生育期主成分等等;构建选择指数[2]。……
登录APP查看全文
