ABCA1基因启动子区域VNTR-ZNF位点多态性及与血浆HDL水平的关系
2011-07-21高慎霞毛用敏赵莉莉崔让庄
高慎霞 毛用敏 陈 倩 赵莉莉 崔让庄
血浆高密度脂蛋白(HDL)水平降低是冠心病(CHD)发生的独立危险因素之一[1]。腺苷三磷酸(ATP)结合盒转运体A1(ATP-binding cassette trans⁃porter A1,ABCA1)在启动胆固醇逆转运和HDL生成起始阶段发挥着关键作用[2]。ABCA1基因序列中某些核苷酸变异可改变其活性并影响HDL水平[3]。ABCA1基因启动子区域有多个转录因子的作用元件,其中-220 bp附近区域为ZNF202的结合位点,此处有一个同向重复序列可变数(variable number of tandem repeats,VNTR)多态位点,为ACCCC插入缺失变异(VNTR-ZNF)。本研究旨在对ABCA1基因启动子区域VNTR-ZNF位点插入/缺失多态性进行观察并探讨其与血浆HDL水平的关系。
1 对象与方法
1.1 研究对象 随机抽取天津市胸科医院2007年9月—2009年4月住院的心肌梗死患者(按照WHO1979年诊断标准)166例(CHD组),其中男116例,女50例,平均年龄(56.2±9.7)岁,均有持续性胸骨后剧烈疼痛,血清心肌酶升高及心电图ST-T变化。对照组99例,为同期本单位健康体检者,其中男71例,女28例,平均年龄(51.9±7.4)岁。
1.2 方法 ( 1)基因组DNA制备采用Triton低渗缓冲液溶血法从白细胞中提取。(2)PCR扩增引物参照文献设计[4],上游引物:5′-CCC TAA GAC ACC TGC TGT ACCC-3;′下游引物:5′-CTG AGA ACC GGC TCT GTT GGT-3′。PCR(扩增体系反应体积为25 μL。各成分终浓度分别为:Tris-HCl 60 mmol/L,(NH4)2SO415 mmol/L,pH 9.5,MgCl22.5 mmol/L,脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)0.2 mmol/L,引物各0.4 μmol/L,Taq酶 2 .5 U,模板DNA 0.5 μg。循环温度:95℃5 min变性;95℃ 3 0 s、62℃ 3 0 s、72℃ 1 min,35个循环;最后72℃延伸7 min。(3)PCR扩增产物经8%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离基因型,用凝胶成像系统分析结果。(4)血脂测定:HDL及HDL亚组采用PEG20000进行沉淀去除低密度脂蛋白(LDL)和极低密度脂蛋白(VLDL),酶法测定上清液中高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平。
1.3 统计学方法 根据公式计算各等位基因频率,Har⁃dy-Weinberg公式计算各基因型(p+q=1,2pq=杂合型基因频率)的理论值(野生型:样本总数×p2;……
