副溶血性弧菌REP-PCR分型研究
2011-07-16许龙岩袁慕云凌莉黄华军邹志飞
许龙岩 袁慕云 凌莉 黄华军 邹志飞
(广东出入境检验检疫局 广东广州 510623)
1 前言
经典的副溶血性弧菌(Vibrio Parahemolyticus,VP)分离培养和鉴定需要1-2周时间,人力物力花费大,不适应实际检验工作的需要。随着分子生物学技术的发展,分子水平上的分型与诊断方法以其敏感性高、特异性强、分型率和分辨率佳的优点,逐渐取代了传统的表型分型技术,在微生物的分型与诊断中发挥巨大的作用[1]。DiversiLab系统(DVL)是以基因外重复回文序列-PCR(Repetitive Extragenic Palindromic- PCR,REP-PCR)技术为原理的自动化分子分型系统,已应用于原核和真核微生物的分子分型,包括具有重要流行病学意义的微生物如不动杆菌、肺炎链球菌、结核分枝杆菌和曲霉[2]。本研究用DVL系统对近几年从食品中分离的21株VP进行REP-PCR分子分型,掌握其在食品中的分子型别,并与PFGE结果相比较,探讨其对VP的分型能力,为VP的快速分型和溯源提供技术基础。
2 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 试验菌株
食品中分离的VP 21株,为本实验室和中国检验检疫科学研究院食品所保存菌株,均用API 20E和VITEK2确认为VP,菌株信息见表1。PFGE分子量标准沙门氏菌H9812为本实验室保存菌株。
2.1.2 主要仪器和试剂
DVL系统、REP-PCR试剂盒及微流体芯片:法国梅里埃公司;
PTC-200型PCR仪、CHEF MAPPER脉冲场电泳仪、Gel Doc XR凝胶成像系统:美国Biorad公司;
一次性血琼脂平板:广州环凯公司。
2.2 方法
2.2.1 DNA 提取
用接种环刮取血平板上分离纯化的VP菌落,使用REP-PCR配套核酸提取试剂盒,按照厂家说明书推荐步骤提取 DNA,DNA浓度控制在25-50ng/uL。
2.2.2 REP -PCR 分型
以提取的VP DNA为模版,使用DVL配套的REP-PCR试剂盒进行PCR扩增,PCR循环参数为:94℃ 2min,94℃30s,50℃30s,70℃90s,35 个循环,70℃ 3min,反应体积为25uL。……
