白花树SRAP—PCR反应体系的建立与优化
2011-05-08柳新红李因刚盛炜彤惠刚盈郑勇奇
柳新红,李 楠,李因刚,徐 梁,盛炜彤,惠刚盈,郑勇奇
(1. 中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091;2. 浙江省林业科学研究院,浙江 杭州 310023)
白花树SRAP—PCR反应体系的建立与优化
柳新红1,2,李 楠2,李因刚2,徐 梁2,盛炜彤1,惠刚盈1,郑勇奇1
(1. 中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091;2. 浙江省林业科学研究院,浙江 杭州 310023)
以白花树叶片的总DNA为模板,通过正交试验设计,确定了适合白花树的SRAP-PCR的20 µL最佳反应体系为:24 ng模板DNA,2.0 mM的Mg2+,0.5 mM的dNTPs,1.25uM的引物,1.5 U的Taq DNA聚合酶,2 µL的10× PCR缓冲液。经琼脂糖凝胶电泳检测,特征性条带清晰,信息量大,稳定。
白花树;SRAP-PCR;反应体系;正交设计
白花树(Styrax tonkinensis)又名越南安息香、滇桂野茉莉、白背安息香,属安息香科安息香属落叶乔木,是热带和亚热带树种,分布于我国的云南、广东、广西、贵州、福建、湖南、江西、重庆等省(市、区)以及越南、老挝等国[1]。该树种生长迅速,成材期短,萌芽力强[2],是制浆、造纸等短周期工业原料林的首选树种之一;同时该树种结果量大,早实丰产,种子含油率高,也是材、油兼用的优良生物质能源树种。此外,白花树树脂“安息香”,含较多香脂酸,是贵重药材[3],有防腐、消炎、祛痰、行气血之效,并可制造高级香料。
相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记是基于聚合酶链式反应(PCR)的新型分子标记技术[4]。该标记根据基因外显子中GC含量丰富的内含子、启动子中AT含量丰富的特点,设计一对适宜引物进行PCR扩增,因不同个体的内含子、启动子与间隔区的长度差异而产生多态性。SRAP标记与RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、ISSR(Inter-Simple Sequence Repeat)、AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequence Repeat)等分子标记技术相比,具有技术简……
