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胰腺癌细胞DPYD、MTHFR基因单核苷酸多态性分析

2011-04-13张孝平张文静陈宝安柏志斌冯继峰

山东医药 2011年45期

张孝平,张文静,陈宝安* ,柏志斌,冯继峰,程 璐

(1东南大学医学院附属中大医院,南京210009;2东南大学医学院肿瘤系;3江苏省肿瘤研究所;4东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室)

胰腺癌(PC)临床发病隐匿,发展迅速,预后极差。据统计,2009年美国新增PC患者42 470例,83%的患者在1年内死亡[1]。目前,手术切除是PC唯一可治愈性方法,但85%的患者就诊时已属晚期或发生远处转移,手术切除率为10% ~15%。因此,化疗在PC综合治疗中占有重要地位。近年来,尽管PC的一线化疗方案多以吉西他滨为基础,但氟尿嘧啶类药物5-FU、卡培他滨等仍是PC化疗中最常用药物。二氢嘧啶脱氢酶(DPD)及亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)是氟尿嘧啶类药物体内代谢的关键酶,为探讨PC细胞株中二氢嘧啶脱氢酶(DPYD)基因、MTHFR基因的单核苷酸多态性(SNPs)位点基因型,2010年12月~2011年8月,我们进行了相关研究。现报告如下。

1 材料与方法

1.1 材料 新生小牛血清(杭州四季青公司),RPMI-1640液(美国 Gibco公司),0.25%胰酶(Sigma公司),DNA 提取试剂盒、dNTP、Taq DNA 酶(德国Qiagen公司)。

1.2 方法

1.2.1 细胞培养及基因组DNA提取 PC细胞株SW1990、PANC-1、CFPAC由东南大学医学院实验室传代培养。将细胞接种于10%小牛血清RPMI-1640培养液,置37℃、5%CO2、95%湿度培养箱中培养,贴壁细胞用0.25%胰蛋白酶消化传代。采用德国Qiagen公司产试剂盒提取基因组DNA。

1.2.2 PCR扩增及产物纯化 采用Assay Designer软件设计PCR引物,PCR引物由上海邃志公司合成,PCR引物序列(略)。PCR反应体系中含有5 ng模板 DNA 的 1 μl、水 0.95 μl、PCR 缓冲液 0.625 μl、2.5 mmol/L 的 dNTP 1 μl、25 mmol/L 的 MgCl20.325 μl、PCR 引物 1 μl及 HotStar Taq 酶 0.1 μl。PCR反应条件为:94℃预变性15 min,94℃变性20 s、56 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共进行45个循环;最后72℃延伸3 min。反应体系包括1.53 μl水、0.17 μl SAP 缓冲液、0.3 U 碱性磷酸酶;该反应在37℃进行40 min,然后85℃、5 min使该酶失活。……

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