熊行创,方 向,欧阳证,江 游,黄泽健,邓玉林,张玉奎

(1.北京理工大学生命科学与技术学院,北京 100081;2.中国计量科学研究院,北京 100013;3.美国普渡大学韦尔登生物医学工程学院,西拉法叶美国 47907)

质谱成像(imaging mass spectrometry,简称IMS)能够同时获取样品的化学成分信息和样品表面化学成分空间分布信息,并以图像的形式直观地反映被测物的物质与空间分布情况。IMS的应用从半导体表面污染物分析到生物组织上的蛋白分析,以及药物分析、法证鉴定、字画鉴定等[1-2]。常用的质谱成像技术MALDI(matrix-assisted laser desorption/ionization)、SIMS(secondary ion mass spectrometry)需要在真空环境下进行,在一定程度上限制质谱成像的应用范围。近年来,随着DESI(desorption electrospray ionization)[3]、L TP(low temperature plasma)[4]、L EDI(electrospray-assisted laser desorption/ionization)[5]等新型敞开式常压离子源与众多大气压接口质谱仪的结合,实现多样的质谱成像分析正在不断地扩大 IMS的应用范围[6]。将众多大气压接口质谱仪获取的原始数据重构为质谱图像数据是实现成像分析的必须处理过程,需要专用的软件工具。Clerens等[7]实现了Bruker公司的 Reflex and Ultraflex质谱仪数据格式转换;Jardin-Mathé等[8]开发的MITICS软件对Applied BioSystems和 Bruker Daltonics公司质谱数据进行图像重构,但是对其他公司的质谱数据却无能为力,同时缺乏各种参数设定的专用化功能和方便用户使用的向导式界面。为此,本工作开发出一种向导式、专用的质谱数据图像重构imgGenegate软件,能将原始质谱数据重构为Analyze 7.5格式,可以通过免费的BioMap软件(http://www.maldi-msi.org)、IMSview 软件(http://msimaging.net)和Matlab开发工具处理。

1 实验方法

1.1 质谱成像实验的数据特点

不论是大气压环境还是真空环境下的质谱成像分析,通常在固定离子源和质谱接口的位置,通过移动样品台实现对样品的扫描分析。……