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利用生物信息学手段改进免疫学课堂教学的实践①

2011-01-23王先龙游自立电子科技大学生命科学与技术学院成都610054

中国免疫学杂志 2011年12期
关键词:数据库课堂教学教学

黄 健 王先龙 游自立 (电子科技大学生命科学与技术学院,成都610054)

作为一门研究机体识别自己与异己机制及其应用的学科,免疫学起源于实践,发展于实验,提升于理念。因此,现代免疫学既是一门实验科学,也是一门理论科学。它不仅涉及先进的实验设备、独到的实验方法,也具有抽象的术语、深奥的理论,在分子层面更是涉及抗原、抗体、补体、MHC、细胞因子等各种免疫分子及其相互作用。如何深入浅出、生动形象地讲解纷繁复杂的免疫分子及其相互作用,激发学生的学习兴趣,提高教学效果,是免疫学课堂教学中值得研究的一个重要课题。近年来,我们将一些生物信息学手段有机融合在免疫学课堂教学中,实现了免疫分子及其相互作用的动态交互操作与展示,取得了不错的教学效果。现将我们的方法与经验总结分享如下。

1 充分利用网络生物信息学资源

生物信息学(Bioinformatics)是将计算机科学与信息技术应用于生命科学,通过对生物数据的采集、存储、管理、挖掘、分析与处理,揭示生命现象内在规律的一门学科。免疫系统及免疫分子是生物信息学的重要研究对象;生物信息学与免疫学的交叉业已形成了一门新兴的交叉学科——免疫信息学(Immunoinformatics)[1]。生物信息学及免疫信息学科研与教学研究的相关成果如专业数据库、软件、网络资源等,均可用于免疫学课堂教学中。

例如,在讲解空间构象表位时,我们使用了空间构象表位数据库(Conformational Epitope Database,CED,http://immunet.cn/ced)[2]。以小鼠抗甲型……

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