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使用优化PAGE电泳及银染技术检测临床粪便样品中的轮状病毒RNA

2010-08-09杨昭庆黄永坤刘馨

中国医药生物技术 2010年4期
关键词:优化检测

杨昭庆,黄永坤,刘馨

人轮状病毒肠炎是世界范围内的一个重要的健康问题,也是引起儿童腹泻并导致死亡的主要原因之一[1]。快速有效地分离、鉴定临床粪便样中的轮状病毒,不仅可以确证轮状病毒的感染,还可以准确监控轮状病毒流行株的变化,积累轮状病毒的流行病学数据。轮状病毒的基因组为双链RNA,分为 11 个节段,不同株型轮状病毒的 RNA 电泳图谱存在差异,可由此初步判定轮状病毒株型别[2]。本文以猴轮状病毒 SA11 株的 RNA 基因组作为模版,对 PAGE电泳和银染的检测条件进行优化,并使用优化后的条件对临床粪便样品进行检测。

1 材料与方法

1.1 主要材料和仪器

猴轮状病毒 SA11 株为本所保存;12 份临床样品来自云南昆明医学院附属第一医院,为儿科急性腹泻小儿粪便样本,收集的时间为 2009 年 11 月,随机编号 1~12 号;A 群轮状病毒胶体金诊断试纸购自北京万泰生物药业有限公司;小量液体样品 RNA 抽提试剂盒购自上海华舜生物技术有限公司;小型垂直电泳槽购自 Bio-Rad 公司。

1.2 方法

在不改变电泳设备的前提下,以猴轮状病毒 SA11 株为模版,对其 RAN 基因组的电泳条件进行了比较和优化,包括不同丙烯酰胺和N,N’-甲叉丙烯酰胺配比、分离胶、积层胶浓度、电压、电泳时间,银染的染色和显色时间。并以优化后条件对细胞培养的不同代次的轮状病毒 RNA 基因组进行检测和重复实验,确定其稳定性。

PAGE 电泳的缓冲液为 TBE,电泳结束后,使用 10%无水乙醇和0.5% 的冰乙酸洗涤凝胶 2 次,每次 5 min,然后使用 0.2% 的硝酸银溶液染色,显色液为 NaOH 和甲醛溶液。……

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