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24个STR基因座在长春市汉族人群的遗传多态性

2020-07-06包赫来于婷婷宋丹璐金海英秦金风

生物化工 2020年3期
关键词:基因座杂合长春市

包赫来,于婷婷,宋丹璐,金海英,秦金风

(1.长春市公安局,吉林长春 130062;2.宁波海尔施基因科技有限公司,浙江宁波 315040)

选用SureID®PanGlobal人类DNA身份鉴定试剂盒对610名长春市汉族人群无关个体进行群体调查,获得相关遗传学参数的基础数据。

1 材料与方法

根据知情同意原则,本实验所用的610份样本均采集自吉林长春地区汉族人群无关个体,以血卡保存,1 mm孔径作为直接扩增模板。采用PanGlobal试剂盒,参照说明书10 μL体系于9700型PCR扩增仪进行扩增。使用ABI 3730基因分析仪进行检测,将检测结果于Genemapper ID-X软件进行分析。

利用等位基因频率调查数据分析软件对群体数据进行统计学分析,结果包括各等位基因频率,观察值杂合度(Observation heterozygosity,Ho)、期望值杂合度(Expect heterozygosity,He)、多态性信息总量(Polymorphism information content,PIC)、个体识别能力(Discrimination power,DP)和三联体非父排 除 概 率(Probability of paternity excluding of trios,PEtrio)[1-2]。根据软件分析获得的数据计算累积DP值(CDP)和累积PEtrio值(CPEtrio)。

2 结果与分析

各等位基因频率分布见表1,共检出320个等位基因,等位基因频率在0.001~0.534。遗传学参数见表2,Ho为 0.640~0.943,He为 0.636~0.944,除 TPOX 和TH01外,其余22个基因座Ho值均大于0.7,表现出高杂合度,体现出较高群体遗传变异水平的鉴别能力;PIC为0.542~0.941,均大于0.5,能提供高度多态性信息;DP为 0.802~0.993,CDP> 0.999 999,除 TPOX、TH01、D3S1358、CSF1PO 和 D10S1248外,其余19个基因座的DP值均大于0.9,体现出较高的个体识别能力;PEtrio为0.371-0.887,CPEtrio>0.999 999,除 TPOX、TH01和D3S1358外,其余21个基因座的PEtrio值均大于0.5,体现出较高的亲权鉴定能力。

表1 长春地区汉族人群无关个体24个STR基因座的等位基因频率(n=610)

续表1

3 讨论

结果表明,本研究针对长春市汉族人群对象选择的24个常染色体STR基因座,均可提供高度多态性信息,其中22个基因座体现出较高群体遗传变异水平的鉴别能力,19个基因座体现出较高的个体识别能力,21个基因座体现出较高的亲权鉴定能力。综上所述,本研究中24个常染色体STR基因座在长春市汉族人群中具有优良的遗传多态性,适用于相关人群的法医学研究。

表2 长春地区人群24个STR基因座群体遗传学参数(n=610)

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