APP下载

白介素13基因+2044G/A多态性与支气管哮喘的关联研究

2015-11-22席素雅刘建强陈树珍张玲王少颖

贵州医药 2015年10期
关键词:等位基因多态性基因型

席素雅 刘建强 陈树珍 张玲 王少颖

(1.河北省胸科医院呼吸科;2.河北省老年病医院,河北 石家庄 050000)

支气管哮喘(哮喘)是一种以气道阻塞、气道炎症和气道高反应为特征的炎症性疾病,呈家族聚集性,其发病涉及了遗传、环境、免疫、神经等因素[1]。多项研究[2-3]表明,白细胞介素13(IL-13)基因多态性与哮喘的发病密切相关。本研究以河北地区汉族人群为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,分析该地区正常人群和哮喘患者IL-13基因+2044G/A 的基因型和等位基因频率分布情况,以探讨该基因多态性与河北地区汉族人群哮喘的相关性,为哮喘患者的早期预防、早期治疗提供理论依据。

1 资料与方法

1.1 临床资料 哮喘组:选择2011年7月至2013年7月河北省胸科医院收治的哮喘患者100例,均符合中华医学会呼吸病学分会哮喘学组2013年制定的《支气管哮喘防治指南》标准[4],其中男48例,女52例,年龄20~65岁。对照组:同期选择我院体检中心健康体检者100例,男50例,女50例,年龄18~66岁,该组人群均无哮喘病史。两组人群年龄、性别差异无统计学意义。研究对象均为无血缘关系的我国北方汉族人,除外罹患严重全身感染、肿瘤、心脏病及肝、肾疾病等系统性疾病。全部入选对象均提前征得患者同意并填写知情同意书。

1.2 方法(1)基因组DNA 提取:取外周血3mL,加入含1.5mg/mL乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na2)的抗凝管中,摇匀,常规酚-氯仿法抽提基因组DNA,-20 ℃冰箱储存备用。PCR-RFLP检测基因型:聚合酶链反应扩增基因组DNA。参照文献[5],IL-13基因+2044G/A 位点引物序列如下:上游:5′-CTTCCGTGAGGACTGAATGAGACGGTC-3′,下 游:5′-GCAAATAATGATGCTTTCGAAGTTTCAGTGGA-3′。25μL PCR反应体系中含:10×缓冲液2.5μL;4×脱氧三组磷组酸组核组苷(dNTP,10 mmol/L)2.0μL;MgCl2(25mmol/L)2.5组μL,10组μmol/L组引组物组各1.0μL,模板DNA(10μmol/L)3.0μL;rTaq DNA聚合酶(5U/L)0.25μL,去离子水加至25μL。扩增反应在热循环仪上完成。循环参数为:95 ℃预变性10min;94℃变性30s,56 ℃退火30s,72 ℃延伸1min,共35个循环;72 ℃最后延伸5min。PCR 扩增产物用限制性内切酶Pst I于37 ℃水浴消化8h,再在3%琼脂糖凝胶上加溴化乙锭(终浓度为0.7μg/mL),取8μL酶切产物在凝胶上上样电泳,紫外线灯照射下观察拍照。(2)测序:PCR 产物纯化并送上海生物工程有限公司进行测序。

1.3 统计学处理 采用SPSS 13.0统计软件。研究资料的可靠性通过Hardy-Weinberg平衡检验检测,基因型和等位基因频率通过基因计数法计算。单个基因型及组间等位基因频率比较采用χ2检验。

2 结果

2.1 IL-13基因型分析 IL-13基因+2044G/A 多态性位点PCR 扩增产物大小为236bp,其上游引物设计的错配碱基G 使该位点扩增产物均存在一个NIaIV 酶切位点,均会被切下一26bp产物。经酶切后,电泳结果可见3种基因型:GG 型(含酶切位点的纯合子,酶切产物为178bp、32bp及26bp);AA 型(不含酶切位点的纯合子,酶切产物为210bp和26bp);GA 杂合子型(杂合子,酶切产物为210bp、178bp、32bp和26bp)。酶切结果见图1,由于32bp和26bp分子量较小,电泳时均已出胶。随机选取3 种基因型样本的PCR 产物进行测序,其结果与PCR-RFLP结果完全一致。

图1 IL-13基因+2044G/A 多态性PCR 产物NIaIV 酶切电泳结果

2.2 两组IL-13基因+2044G/A 基因型和等位基因分布频率比较(1)经Hardy-Weinberg 平衡检验,两组基因型符合遗传平衡,具有群体代表性。见表1。(2)IL-13+2044G/A 位点基因多态性分布特点:IL-13基因+2044G/A组多态性有3组种基因型,GG组型、AA组型、GA组型,两组组人组群组中组均组以GG组型组为主,GA 型次之,AA 型最少。分析显示:哮喘组IL-13+2044G/A 位点基因型分布与正常对照组有差异(χ2=7.71,P<0.05)。A 等位基因携带者(GA+AA 基因型)在哮喘组(49例,49.0%)明显高于对照组(30例,30.0%)(χ2=7.55,P<0.01),差异有统计学意义。见表2。

表1 IL-13基因+2044G/A 位点基因型分布的Hardy-Weinberg平衡检验(%)

表2 IL-13基因外显子+2044G/A 多态性基因型和等位基因频率分布比较[n(%)]

3 讨论

支气管哮喘是由免疫球蛋白E(IgE)介导的Ⅰ型变态反应性疾病,其发生过程中有多种细胞因子参与。IL-13是一种主要由活化的CD4+Th2细胞分泌的多效能细胞因子,具有多种生物学功能,通过提高B细胞的活性、刺激B 细胞的增殖和诱导IgE的合成,从而导致气道反应性增高以及小气道结构重建,参与哮喘炎症的发生与维持[6]。

人IL-13(hIL-13)基因序列长度为4.6kb,含有4个外显子和3 个内含子。编码hIL-13的基因定位于5q31,分子量约12KD,是由132个氨基酸组成的非糖基化蛋白。近年国内外多项研究[7-11]及Meta分组析[12-14]显组示,IL-13基组因A2044G组单核组苷组酸多态性与哮喘发病密切相关,是哮喘发病的独立危险因素。文献[7-11]研究发现,+2044G/AA 等位基因与哮喘的发病密切相关。而华丽等[15]研究发现,G 等位基因可能是哮喘的易感基因。

本研究以河北地区汉族人群为研究对象,分析了100例哮喘患者和100例健康人群的IL-13 +2044G/A 基因型和等位基因分布频率。结果显示,中国北方汉族人群IL-13 基因+2044G/A 位点存在G→A 突变,且该基因型已达到遗传平衡,具有群体代表性。哮喘组AA 型和A 等位基因频率明显高于对照组,A 等位基因频率在哮喘组(29.5%)明显高于对照组(17.5%),差异有统计学意义,表明A等位基因可能是河北地区哮喘发病的易感基因。

研究发现,IL-13基因第4外显子的2044位碱基存在G→A 突变,从而导致编码的相应蛋白质的多态链第130位氨基酸由精氨酸(Arg)转变为谷氨酰胺(Gln),Gln 可能促进受体与IL-13 结合,由于空间结构的改变使IL-13 信号传导途径JAKSTAT6异常,从而影响IL-13的生物学活性。因此在碱基改变的结构基础上,进一步从蛋白功能角度研究这一改变对IL-13 转录及表达的影响,将对哮喘疾病的诊断和治疗有重要意义。

[1]Vercelli D.Genetics and biology of asthma 2010:La’ci darem la mano…[J].J Allergy Clin immunol,2010,125(2):347-348.

[2]Park HW,Lee JE,Kim SH,et al.Genetic variation of ILl3as a risk factor of reduced lung function in children and adolescents:A cross-sectional populationbased study in Korea[J].Respir Med,2009,103(2):284-288.

[3]Kim HB,Kang MJ,Lee SY,et al.Combined effect of tumour necrosis factor-alpha and interleukin-13polymorphisms on bronchial hyperresponsiveness in Korean children with asthma[J].Clin Exp Allergy,2008,38(5):774-780.

[4]中华医学会呼吸病学分会哮喘学组,中华医学会全科医学分会.中国支气管哮喘防治指南:基层版[S].中国实用内科杂志,2013,36(5):331-336.

[5]Graves PE,Kabesch M,Halonen M,et al.A cluster of seven tightly linked polymorphisms in the IL-13 gene is associated with total serum IgE levels in three populations of white children[J].J Allergy Clin Immunol,2000,105(3):506-513.

[6]Giuberqia V,Gravina LP,Castanos C,et al.Influence of beta2-adrenoceptor polymorphisms on the response to chronic use of albuterol in asthmatic children[J].Pediatr Pulmonol,2008,43(5):421-425.

[7]魏明,佘红纯,李素娟.白细胞介素IL-13基因多态性与哮喘易感的关系[J].中国临床医学,2007,14(3):329-330.

[8]舒磊.IL-13基因多态性位点rs20541和rs1800925单核苷酸多态性与儿童支气管哮喘关联性的研究[J].浙江中西医结合杂志,2012,22(4):254-255.

[9]冯丹.哮喘患者及其一级亲属IL-13基因多态性的研究[J].黑龙江医学,2009,33(7):481-482.

[10]丁宝栋,管立学,李海波,等.IL-13+2044GA 多态性与儿童支气管哮喘关联性研究[J].潍坊医学院学报,2013,35(5):331-333.

[11]Liu Q,Hua L,Fang D,et al.Interleukin-13and RANTES polymorphisms in relation to asthma in children of Chinese Han nationality[J].Asian Pac J Allergy Immunol,2013,31(3):247-252.

[12]Li X,Zhang Y,Zhang J,et al.Asthma susceptible genes in Chinese population:a meta-analysis[J].Respir Res,2010,11:129.

[13]Yang H,Dong H,Dai Y,et al.Association of interleukin-13 C-1112T and G +2044A polymorphisms with asthma:a meta-analysis[J].Respirology,2011,16(7):1127-1135.

[14]Nie W,Liu Y,Bian J,et al.Effects of polymorphisms-1112C/T and +2044A/G in interleukin-13 gene on asthma risk:a meta-analysis[J].PLoS One,2013,8(2):56-65.

[15]华丽,鲍一笑,吕婕,等.IL-13基因和β2-AR 基因单核苷酸多态性与儿童哮喘的关系[J].临床儿科杂志,2008,26(1):30-32.

猜你喜欢

等位基因多态性基因型
单核苷酸多态性与中医证候相关性研究进展
亲子鉴定中男性个体Amelogenin基因座异常1例
CLOCK基因rs4580704多态性位点与2型糖尿病和睡眠质量的相关性
广东汉族人群Penta D基因座off-ladder稀有等位基因分析
贵州汉族人群23个STR基因座的OL等位基因研究
WHOHLA命名委员会命名的新等位基因HLA-A*24∶327序列分析及确认
蒙古斑在维吾尔族新生儿中分布的多态性
西安地区育龄妇女MTHFRC677T基因型分布研究
作物遗传育种研究进展Ⅴ.表型选择与基因型选择
ZNF804A rs1344706多态性与精神分裂症的关联分析