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抗艾滋病药地达诺辛光学活性的模拟与标注

2015-02-07汪丽升裴诗恩黄恩玲吴赛青刘诗咏钟爱国

当代化工 2015年9期
关键词:胺基吸收光谱拉曼

汪丽升,裴诗恩,黄恩玲,吴赛青,刘诗咏,钟爱国

(台州学院医药化工学院,浙江 台州 318000)

抗艾滋病药地达诺辛光学活性的模拟与标注

汪丽升,裴诗恩,黄恩玲,吴赛青,刘诗咏,钟爱国

(台州学院医药化工学院,浙江 台州 318000)

基于量子化学理论的基组和方法, 对抗艾滋病药物地达诺辛分子的紫外-可见吸收光谱,红外吸收光谱, 核磁共振吸收氢和碳光谱等进行了计算与标注。自然原子轨道电荷和前线分子轨道图模拟表明,杂环胺基官能团上的氮和氢原子可能是其生理活性的反应位。

地达诺辛;密度泛函活性理论;电子吸收光谱

地达诺辛(Dideoxyinosine,C10H12N4O3)又称去羟肌苷,为人免疫缺陷病毒(HIV) 复制抑制剂, 它能干扰和抑制病毒逆转录酶而阻止病毒的复制。由人工化学合成,1991年11月美国首次上市,为美国第二个被批准用来治疗HIV感染的药物,但是市面上该新药真假难辨[1-4]。本研究拟用量子化学理论方法, 对标题分子(C10H12N4O3)的经典分子-电子吸收光谱如UV-Vis,IR,Raman,1HNRM,13CNMR以及药理作用位等进行了模拟和标注,获得满意的结果[5]。

1 计算与方法

对地达诺辛分子(Dideoxyinosine,C10H12N4O3),采用量子化学理论方法在 6-311+G(d,p)上, 进行模拟(图1)。在稳定构型基础上,采用振动分析法, 于Gaussian 09W程序包完成光学性质的模拟与标注。

图1 地达诺辛(C10H12N4O3)分子编号及结构Fig.1 Dideoxyinosine molecule number and structure

2 结果及讨论

2.1 分子紫外-可见吸收光谱

图2 地达诺辛标题分子紫外吸收模拟光谱图Fig.2 UV-Vis of dideoxyinosine molecular

在用上述程序建构分子模型后,利用基态方法在6-311+G水平上进行了结构优化。在获得稳定构型后,采用不同方法:(1)TD-DFT下使用不同基组(包括STO-3G, 3-21G, 3-21+G, 6-31G, 6-31+G)在不同溶剂中进行计算;(2)利用半经验方法ZINDO计算不同气性溶剂中的紫外-可见光谱。通过比较两种方法的计算结果,寻找最接近实验数据的模拟与计算条件。最后基于TD DFT/B3LYP/6-311+G(d,p)基组和方法,计算分析发现(图2), 标题去羟基苷分子在450.0 nm (强吸收)处显示了紫外吸收峰,可对应于 n→σ* 的跃迁。这与其实验品标准图谱显示标题分子在455.0 nm处有较强的分子电子紫外-可见吸收峰相吻合。

2.2 红外吸收光谱

量子化学理论模拟显示(图3), 地达诺辛分子指纹区峰(<500 cm-1)多而复杂,没有强的特征性,可能源于单键碳-氧、碳-氮和碳-卤素原子等的面内伸缩-振动吸收及碳-氢、氧-氢等含氢基团的面外弯曲-振动以及碳-碳骨架振动吸收产生。而在510 cm-1(弱,面内弯曲振动),1 500 cm-1(弱,面外弯曲振动),2 250 cm-1(弱,甲基的C-H反对称伸缩振动)以及5 500 cm-1等处(对称伸缩振动)分别显示了其红外吸收峰,谱图中1 700 cm-1左右有一个强吸收峰,则可断定分子中有羰基(-C=O)。这些峰与地达诺辛分子实验图谱在5091, 1 510, 2 400, 5 100 cm-1等处有吸收基本吻合。

图3 地达诺辛分子红外吸收模拟光谱图Fig.3 IR of dideoxyinosine molecular

2.3 拉曼吸收光谱

拟用量子化学的理论及方法,我们在对标题分子进行了分子构型寻优及振动分析,获得了 13个Raman吸收峰。图4是模拟的标题分子去羟肌苷的拉曼散射谱特征峰,它主要位于510, 2 340,5 430 cm-1范围内。如对比标准品的拉曼图谱与模拟拉曼图谱,我们认为它们是基本吻合的。

图4 地达诺辛分子拉曼吸收模拟光谱图Fig.4 Raman of dideoxyinosine molecular

2.4 核磁共振氢谱和碳谱吸收

理论模拟了标题分子的氢核磁共振吸收谱图(1HNMR,图5(上),其主链CH(强,8.12,2.76 ×10-6),支链 CH(中,5.95, 2.76×10-6); 支链CH2(中,3.79,1.10×10-6); 支链CH2(弱,2.16,2.74× 10-6);羟基氢(弱,2.0,2.0×10-6) 。这些峰较好地与其实验氢值和碳谱(13CNMR,下)吻合起来,间接验证了计算的准确性。

图5 地达诺辛分子氢谱和碳谱吸收模拟光谱图Fig.51HNMR and13CNMR of dideoxyinosine molecular

2.5 药理活性

表1的模拟原子电荷显示,药物分子地达诺辛胺基氮(N9)的原子电荷值为最负(-0.343 e),其次为与胺基氮相连的碳原子(C8,-0.179 e); 原子电荷值最正的可能是胺基上的氢原子(H19, 0.165 e)。前线分子轨道图(图6)表明,杂环胺基原子(NH)可能是其发挥药理活性的反应位置。

Simulation of Optical Properties of Dideoxyinosine by DFT

WANG Li-sheng, PEI Shi-en, HUANG En-ling, WU Sai-qing, LIU Shi-yong, Zhong Ai-guo
(College of Chemical Engineering and Pharmacy, Taizhou University, Zhejiang Taizhou 318000, China)

Using density functional theory DFT/B3LYP/6-311+G(d, p) method and basis set on dideoxyinosine, electronic spectra of UV-Vis spectroscopy, IR spectroscopy and1HNMR spectrum were theoretically simulated and identified. Natural charge calculations show that N and H atoms on heterocyclic amine may play the pharmacological activity center.

dideoxyinosine; density functional theory; electronic spectra

表1 标题分子的NBO净电荷布居值Table 1 NBO charge population of Dideoxyinosine e

TQ 624.3

B

1671-0460(2015)09-2088-02

浙江省大学生科技创新项目(2014R428015)和国家级大学生创新训练计划(201510350015)资助。

2015-04-10

汪丽升(1994-),男,浙江淳安人,研究方向:有机合成。从事材料化学工作。E-mail:1113669202@qq.com。

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