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食品中产志贺毒素大肠杆菌的多重PCR检测

2010-09-12李睿戴诗皎杨敬镜瞿敏刘志国

食品研究与开发 2010年11期
关键词:毒力毒素菌落

李睿,戴诗皎,杨敬镜,瞿敏,刘志国

(武汉工业学院生物与制药工程学院,湖北武汉 430023)

食品中产志贺毒素大肠杆菌的多重PCR检测

李睿,戴诗皎,杨敬镜,瞿敏,刘志国

(武汉工业学院生物与制药工程学院,湖北武汉 430023)

针对产志贺毒素大肠杆菌的stx2、wzy、hlyA的保守序列,设计特异性的引物,建立一种新的多重PCR检验方法。结果显示,该方法特异性强,扩增结果与各参考菌株基因型一致,并能良好的区分出O157菌株和非O157型产志贺毒素大肠杆菌。该方法能用于食品样品的检测和流行病学分离株的快速鉴定。

产志贺毒素大肠杆菌;多重PCR;hlyA;stx2;wzy

Abstract:Specific primers were designed according to the conserved loci of stx2,wzy and hlyA genes of Shiga toxin-producing Escherichia coli(STEC).A Multiplex PCR method was then developed.The result demonstrated that this method was highly specific.It detected the presence of the three target genes in a manner consistent with the known genotype of each reference strain.O157 and non-O157 STEC strains could also be well distinguished.The multiplex PCR developed in this study could be used for mass screening of food samples,and identification of clinical STEC isolates.

Key words:Shiga toxin-producing Escherichia coli;multiplex PCR;hlyA;stx2;wzy

产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC;或称 Vero toxin-producing Escherichia coli,VTEC)是食品主要病原菌之一[1]。STEC 包括 O157:H7、O157:H- 、O6、O26、O111、O91 等血清型[2]。世界上许多国家相继发生了STEC的感染流行,对食品安全造成严重危害[3]。STEC主要毒力因子是stx1、stx2基因,分别编码志贺毒素1和志贺毒素2。两种毒素毒力不同,志贺毒素2比志贺毒素1毒力更强,更易引起出血性肠炎、溶血性尿毒综合症等食物中毒并发症[4]。大质粒上编码溶血素的hlyA基因亦是STEC重要毒力因子[5]。目前STEC的检测是一个难点。以O157特异的标志基因-O抗原聚合酶基因wzy和stx2、hlyA基因开发多重PCR检测技术,为检测食品中的STEC菌株提供新的思路和方法。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.1.1 菌株

大肠杆菌 O157:H7 EC1、EC2、EC3:均为日本九州大学生命科学与技术学院食品卫生实验室赠送;大肠杆菌O157:H7 EC4号菌株、单核增生李斯特氏菌、副溶血弧菌、沙门氏菌:武汉市疾病预防控制中心提供;大肠杆菌O157:H7 EC5号菌株、普通大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、蜡样芽孢杆菌由武汉工业学院食品安全实验室保存。

1.1.2 试剂

CT-SMAC培养基:青岛海博生物技术有限公司;新生霉素:上海创赛科学仪器有限公司;GoldView核酸染料:上海赛百盛基因技术有限公司;AxyPrep细菌基因组试剂盒、Taqmix预混合PCR试剂盒武汉华顺生物技术有限公司;DNA marker、引物合成:武汉鼎国生物技术公司。

1.2 方法

1.2.1 DNA模板制备

将O157菌株接种到LB液体培养基中,37℃过夜培养,然后用AxyPrep细菌基因组试剂盒提取DNA。

1.2.2 多重PCR检测体系

PCR 体系为:8 μL dd H2O,12.5 μL 2×Taqmix 混合液,10 μM wzy 上下游引物各 1 μL,10 μM stx2 上下游引物各 0.5 μL,10 μM hly 上下游引物各 0.25 μL,1 μL DNA。PCR扩增程序:94℃变性1 min,55℃45 s,72℃60 s,共35个循环;72℃延伸10 min。

1.2.3 多重PCR特异性实验

用本实验室保存的各种菌株提取DNA,做多重PCR检测,确定引物的特异性。

1.2.4 多重PCR灵敏度实验

用大肠杆菌EC1号菌株DNA为模板,梯度系列稀释后,做多重PCR检测,确定灵敏度。

1.2.5 人工染菌样品实验

将EC1号菌株LB液体培养基过夜培养16 h~20 h,然后10倍梯度稀释。取100 μL梯度稀释菌液营养琼脂平板培养,进行菌落计数。同时取无大肠杆菌O157感染的新鲜牛肉25 g,将牛肉均质,加入10-1梯度稀释菌液,振荡混合0.5 h。取1 mL混合液,离心后用AxyPrep细菌基因组DNA试剂合提取DNA。然后梯度稀释,进行多重PCR,确认检出限。

2 结果与分析

2.1 多重PCR引物设计

在 NCBI GenBank数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)下载wzy和stx2基因序列,在保守区内设计引物。hlyA基因引物参照文献[6]。引物对见表1。

表1 多重PCR引物序列信息Table 1 Sequences of primers in the multiplex PCR

2.2 多重PCR特异性实验

前期研究结果表明,大肠杆菌O157:H7 EC1、EC2、EC3、EC4、EC5 号菌株均携带两种志贺毒素和hlyA基因,多重PCR检测结果与之一致,3组引物扩增均能得到预期PCR产物,见图1。单核增生李斯特氏菌、副溶血弧菌、沙门氏菌、普通大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、蜡样芽孢杆菌等则呈阴性结果(图片未附),表明多重PCR特异性强。

2.3 多重PCR灵敏度实验

用纯菌DNA做多重PCR灵敏度验证试验,DNA浓度为1.88 ng/μL时,3组基因都能良好扩增出。DNA浓度持续降低,stx2、wzy引物对灵敏性下降,但hlyA基

2.4 人工染菌样品试验

当稀释度为10-5时,stx2、wzy基因有模糊的产物条带。稀释度为10-9时,仍可检测hlyA基因,对应平板菌落计数为平板菌落计数为1.2 cfu/mL。将3组基因均能获得良好扩增的对应稀释度作为检测的最高灵敏度,则多重PCR检测的最高稀释度为10-5。每个稀释度相应进行平板计数,稀释度为10-5时,平板菌落计数为 1.2×104cfu/mL。

3 结论

STEC的检测是一个难点,传统检测方法一般是通过平板分离出单菌落后,采用免疫试剂盒测定志贺毒素,或采用特异性核苷酸探针鉴定单菌落的stx基因[7]。STEC毒力复杂,大质粒上编码溶血素的hlyA基因、编码紧密粘附素的eae基因等,可增强STEC的毒力[7]。此种检测STEC的多重PCR技术,可同时检测stx2、hlyA两种毒力基因和wzy基因。O抗原聚合酶基因wzy基因是O157血清型大肠杆菌的特异基因,可鉴别出O157菌株。O157是STEC最主要的血清型,也是STEC最常见的引起食物中毒的血清型。通过扩增这三组基因,不仅可区分出O157,还可鉴定出菌株的毒力情况,为流行病学研究和食品安全控制提供更全面的信息。本文报道的多重PCR技术,能满足实际检验要求。多重PCR引物之间容易相互干扰,形成引物发夹环或引物二聚体,导致检测灵敏度降低。多重PCR体系中hlyA基因扩增优于另两组基因,可在后续试验中继续优化PCR体系和反应条件,以进一步提高stx2和wzy基因的检测灵敏度。

[1]Mainil J G,Daube G.Verotoxigenic Escherichia coli from animals,humansandfoods:who’swho[J].JApplMicrobiol,2005,98(6):1332-1344

[2]Law D.Virulence factors of Escherichia coli O157 and other Shiga toxin-producing E.coli[J].J Appl Microbiol,2000,88(5):729-745

[3]Eklund M,Scheutz F,Siitonen A.Clinical isolates of non-O157 Shiga toxin-producing Escherichia coli:serotypes,virulence characteristics,and molecular profiles of strains of the same serotype[J].J Clin Microbiol,2001,39(8):2829-2834

[4]Eklund M,Leino K,Siitonen A.Clinical Escherichia coli strains carrying stx variants and stx-positive virulence profiles[J].J Clin Microbiol,2002,40(12):4584-4593

[5]周勇,万成松.大肠杆菌O157:H7的毒力岛与毒力因子的研究进展[J].微生物学免疫学进展,2006,34(2):58-62

[6]Wang G H,Clark C G,Rodgers F K.Detection in Escherichia coli of the genes encoding the major virulence factors,the genes defining the O157:H7 serotype,and components of the type 2 Shiga toxin family by multiplex PCR[J].J Clin Microbiol,2002,40(10):3613-3619

[7]罗霞,徐建国.产志贺毒素型大肠杆菌的研究进展[J].疾病监测,2006,21(4):217-220

A Multiplex PCR System for the Detection of Shiga Toxin-producing Escherichia Coli in Food

LI Rui,DAI Shi-jiao,YANG Jing-jing,QÜ Min,LIU Zhi-guo
(College of Biological and Pharmaceutical Engineering,Wuhan Polytechnic University,Wuhan 430023,Hubei,China)

2010-04-13

李睿(1972—),女(土家),副教授,博士,现从事食品安全方向研究工作。

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