在生物体的氨基酸组成中，1个氨基酸可以对应多种密码子。编码同一类氨基酸的多个密码子叫作同义密码子[1]。在蛋白合成过程中，同义密码子的使用频率存在差异，且物种和基因对某一种或几种密码子的使用具有偏好性[2]。目前，用于解释密码子偏好性现象的主要是2种经典理论模型，即“中性理论”和“选择-突变-漂变”学说[3-4]。密码子偏好性分析是一种较为复杂的生物学问题，其影响因素主要是自然选择和突变压力，除此之外，碱基组成、基因表达水平、GC含量、转运RNA丰度、RNA结构、蛋白质结构、基因长度等也是影响密码子偏好性形成的因素[5-7]。进行各个物种间密码子偏好性使用差异的分析，可以了解各个物种间的进化起源关系和基因的进化规律，进一步探究和分析某个基因在进化过程中所受到的选择压力或者突变压力的影响[8]。同时，通过对密码子偏好性的分析，有助于了解基因转录和翻译的分子机制，达到有效预测基因外源表达系统和最佳表达宿主的目的[9]

cdx2基因属于尾型同源盒基因（caudal-relatedhomeoboxgene）家族成员，从胚胎发育的前期到成熟期均有表达，在肠道上皮形态的发生、维持以及分化等方面发挥重要作用[10]。cdx2基因及其相关的蛋白最早由Mlodzik从果蝇中成功分离，与 parahox家族呈高度的同源性[1]。近年来，人体染色体研究结果显示， cdx2 基因位于染色体的13q12＼～13区，全长为 22～23kb ，由 cdx2 基因编码的蛋白含313个氨基酸，按照螺旋-环-螺旋的形式结合在DNA的相关位置，以转录因子的方式……