基于转录组测序技术分析补骨脂素对HepG2细胞的作用机制*
2024-03-14汪思云李艺博谭春霞卢涛
汪思云 李艺博 谭春霞 卢涛
北京中医药大学生命科学学院,北京 102488
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)在全球癌症相关死亡病例中位居第四,其发病率呈上升趋势,死亡率接近全球发病率[1]。HCC疾病的预后很差,因此寻找有效的治疗肝细胞癌的方法和药物是抗肿瘤的热点之一。
补骨脂有温肾助阳、纳气止泻的功效,具有免疫调节、抗炎、抗肿瘤和促进骨生长等多种药理作用[2]。补骨脂素(psoralen,PSO)是补骨脂的呋喃香豆素类化合物,有研究报道其对HepG2细胞有体外细胞毒性,且能够逆转阿霉素耐药[3]。补骨脂素还可通过调节Wnt/β-actin通路使MCF-7细胞周期停滞,抑制细胞增殖[4]。但是补骨脂素对肝癌HepG2细胞的作用机制研究尚不够深入。
RNA-seq技术是指利用高通量测序技术,将细胞或组织中的mRNA、微小RNA和长链非编码RNA进行高通量测序分析,在一定条件和时间下比较来自不同组织和条件的基因表达谱,进而得到差异表达基因[5],有助于认识疾病发生发展过程和药物在生命体的作用机制。
补骨脂素在抗肿瘤、治疗白癜风顽疾、白血病等方面有众多临床应用,本研究应用转录组测序技术分析补骨脂素对HepG2细胞作用后基因表达水平的差异,探索其可能的作用靶点和机制,为补骨脂素的临床合理用药研究和应用提供参考。
材料与方法
1 主要试剂和仪器
补骨脂素购于上海源叶生物科技有限公司(B20123-20 mg);细胞增殖及毒性检测试剂盒(CCK-8)增强型(CK001);二甲亚砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)购于北京兰博利德生物技术有限公司(D5879-1);胎牛血清(04-001-1)、DMEM培养基(01-057-1A)、冻存液(05-065-1)均购于以色列Biological Industries公司;……
