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细菌非编码小RNA的生物学特征及作用机制研究进展

2023-06-21王海燕贺婷停李昊阳

四川师范大学学报(自然科学版) 2023年5期

王海燕 贺婷停 李昊阳

摘要:细菌非编码小RNA(sRNA)是一类长度为50~500 nt、一般不编码蛋白质的具有调控功能的小RNA,主要通过与靶mRNA碱基配对或与靶蛋白质结合,在转录后水平发挥调控作用.sRNA参与细菌氨基酸代谢和转运、环境胁迫响应以及毒力作用等众多重要生理过程的调控,与传统的转录因子等构成多层级的调控网络,协同作用使细菌对环境变化做出快速且精细的响应.由于sRNA在细菌调控网络中的重要作用,发现新的sRNA并阐明它们的调控功能成为原核生物基因表达调控研究的一个热点.本综述对细菌sRNA的筛选、鉴定、作用机制以及生物学功能等方面取得的进展进行总结,希望给相关领域的研究者提供一个较为全面的视角.

关键词:细菌; 非编码sRNA; 转录后调控

中图分类号:Q939.1 文献标志码: A 文章编号:1001-8395(2023)05-0581-10

细菌常常暴露在恶劣的自然环境中,为了应对外界环境的变化,细菌已进化形成一套精密的应答机制来适应各种环境变化.长期以来,普遍认为细菌基因的表达调控主要存在于转录水平,现在发现细菌中同样存在由非编码RNA介导的转录后调控.细菌非编码RNA是一大类具有调控功能的RNA分子,通过各种机制调控多种生理过程,这些RNA包括核开关(riboswitch)、CRISPR RNA、非编码小RNA(sRNA)等[1],其中sRNA是研究最多的一类转录后调控因子.细菌sRNA通常不进行翻译(但是也有例外[2-3]),主要通过与被调控的靶mRNA进行碱基配对来调控靶标的翻译或稳定性[4],少数sRNA通过与蛋白质结合发挥功能[5].和蛋白類……

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