刘金婵 许德华 李让 唐田书 陈铭 陈晓琳 饶绍奇

在2020年全球癌症统计中,肺癌是第二常见,也是死亡率最高的癌症,对人类健康构成了严重的威胁。肺癌分为小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC,15%)和非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC,85%)[1];NSCLC早期患者以手术治疗为主,Ⅲ期是同步放化疗后免疫治疗,但患者存活率均较低[2]。因此,找到与NSCLC发生发展相关的分子机制,发现有效的早期诊断生物标志物以及临床治疗的潜在靶点,改善患者的生存和预后,极为重要。circRNA存在共价闭合的单链环构象,不易受到破坏,并且存在一个或多个miRNA反应元件(miRNA response element,MRE)[3],可基于竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)机制参与癌症发展过程中,如circRNAs可作为ceRNA,与miRNA中的MRE结合,减少miRNA与其靶mRNA结合,从而调节miRNA对靶mRNA的抑制作用。先前研究认为circRNA与各种疾病的发展过程都具有显著地相关性,尤其是关于癌症的进展过程[4],同时,circRNA在癌症细胞和各种体液[5]中特异表达,反映出circRNA作为NSCLC诊断生物标志物或治疗靶点的极大潜力。在这项研究中,从TCGA数据库和GEO数据库获取的芯片数据,得到NSCLC中差异表达的circRNA、miRNA 和 mRNA并通过这3种RNA来进行ceRNA网络的构建并识别出网络中的核心circRNA,并从中提取了NSCLC特异性ceRNA核心子网络;最后把 ceRNA 机制作为探索非NSCLC发展过程的出发点,来进一步说明核心 circRNA在其中是如何通过调控基因的表达从而作用于癌症的发展机制,为开展NSCLC的致病机制、诊断生物标志物与治疗潜在靶点等研究提供参考。

1 资料与方法

1.1 一般资料 本研究使用的3个circRNA芯片数据GSE101586 (5病例,5对照),GSE101684 (4病例,4对照) 和 GSE112214 (3病例,3对照)均来源于GEO(gene expression omnibus)数据库。……