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基于LASSO 回归筛选影响肺腺癌患者预后的糖酵解相关基因*

2023-02-13杜也米热阿依阿布都热孜克左冉袁东琪霍庚崴陈金良张翠翠孟昭婷陈鹏

中国肿瘤临床 2023年1期
关键词:差异分析模型

杜也 米热阿依·阿布都热孜克 左冉 袁东琪 霍庚崴 陈金良 张翠翠 孟昭婷 陈鹏

肺癌是全世界癌症相关死亡的最常见原因,占癌症死亡总人数的18.4%[1]。尽管手术治疗、放化疗及分子靶向治疗取得了一定进展,但肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)患者的生存率仅4%~7%[2]。因此仍需确定更多具有诊断和预后价值的分子标志物。代谢重编程是癌症的重要标志[3],糖酵解水平升高和线粒体代谢受抑制已经在多种癌症中被验证[4]。糖酵解不仅能够通过产生ATP 和乳酸促进癌细胞存活,还能通过磷酸戊糖途径为癌细胞提供用于生物合成的核苷酸、脂质和非必需氨基酸[5]。此外,有报道糖酵解通过激活多种信号通路导致促进癌细胞的增殖、迁移、侵袭和耐药[3,6-8]。糖酵解相关基因与多种癌症预后相关,如TCF7L2 的高表达与胰腺癌的不良预后相关[9],CLDN9、B4GALT1、GMPPB、B4GALT4、AK4、CHST6、PC、GPC1 和SRD5A3 与子宫内膜癌预后相关[10]。

本研究旨在基于癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中的数据评估LUAD 中糖酵解相关基因的表达,研究与LUAD 的预后相关的糖酵解相关基因。为此,本研究建立6 个基因风险预测模型。预后模型的应用有助于指导临床决策,对精准医疗至关重要。经验证,该模型可以作为一个独立的因素预测患者预后,且预后性能明显优于其他临床特征。

1 材料与方法

1.1 临床资料

535 例LUAD 样本及59 例正常肺组织样本的mRNA 表达量及对应患者临床信息均通过TCGA 数据库获取,对数据进行归一化处理,排除临床信息不完整的样本。

1.2 方法

1.2.1 基因富集分析 基因富集分析使用基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)识别LUAD 样本和正常肺组织样本的糖酵解相关基因是否存在显著差异[11]。……

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