21个物种生长激素基因完整编码区比较基因组学分析
2022-12-09宋兴超孟金柱赵园园吴震洋安清明
宋兴超,孟金柱,赵园园,吴震洋,安清明
(铜仁学院农林工程与规划学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州 铜仁 554300)
脊椎动物生长激素(growth hormone,GH)由脊椎动物脑垂体前叶嗜酸性细胞合成和分泌,它和催乳素(prolactin,PRL)及胎盘催乳素(placental lactogen,PL)属同一个基因家族,是与脊椎动物生长发育关系最为密切的一种单链多肽类激素[1]。GH的主要生物学功能是促进蛋白质和核酸的合成[2],参与脂肪分解和葡萄糖吸收[3],加速脊椎动物骨骼和肌肉的生长发育[4]等。此外,GH 基因是一种宝贵的基因资源,在转基因畜禽品种培育和生长激素制剂开发等方面具有重要的应用价值。迄今为止,国内外对该基因的研究主要集中于马鹿[5]、梅花鹿[6,7]、狐狸[8]、山羊[9,10]和家兔[11,12]等哺乳动物与鸡[13]、鸭[14]等禽类以及鱼类[15,16]GH 基因的克隆及其变异位点与重要经济性状的相关性等方面。随着基因组学大数据的逐渐更新,美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GenBank 数据库中也集中收录了大量物种GH 基因相关DNA 或mRNA 序列,然而,在分子水平上对生长性状相关基因的研究还相对薄弱,远远满足不了当今组学时代研究基因对生长性能影响机制的需要,同时也较少有研究者从比较基因组学角度探究不同物种GH 基因的变异及遗传多样性。为此,本研究选取GenBank公共数据库中已报道的马鹿等21 个物种的GH基因完整编码区序列(codingregionsequence,CDS),利用比较基因组学和生物信息学结合的方法分析了不同物种间和物种内GH 基因的遗传多样……
