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miR-203a-3p靶向GLS1调控HCC细胞增殖、迁移、侵袭的机制研究

2022-10-15时晓晓于若卉苏君君齐东东

现代检验医学杂志 2022年5期
关键词:谷氨酰胺靶向通路

时晓晓,董 翔,于若卉,苏君君,齐东东,白 杨,董 猛

(河北省沧州中西医结合医院a.肝胆外二科;b.耳鼻咽喉科,河北沧州 061000)

肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是临床常见的恶性肿瘤,约占全部肝癌的70%~90%,致病、致死率较高,患者预后较差[1]。近年研究表明,肿瘤的发生发展是多因素、多步骤、多通路异常调控的复杂过程,涉及致癌基因的异常激活和抑癌基因的失活[2]。基于分子生物学的大量研究也表明,微小核糖核酸(microRNAs, miRNA,miR)在人类众多肿瘤中异常表达,可与mRNA转录本的3'-UTR区结合,促使mRNA降解或抑制其表达翻译,调控细胞生长、分化及迁移、凋亡等生物学行为[3]。证实miRNA能够调控促癌基因或抑癌基因,参与肿瘤的发生、发展及转移,为肿瘤研究提供了新方向[2]。miR-203a-3p是近年研究的miRNA分子,大量研究表明其在胃癌、胰腺癌、非小细胞肺癌等多种恶性肿瘤中异常表达,在肿瘤细胞增殖、侵袭及凋亡、耐药等过程中发挥重要作用,是许多疾病和癌症的潜在分子标记物[4-6]。相关研究表明,细胞内能量代谢改变是肿瘤细胞的特征之一,肿瘤细胞大多存在谷氨酰胺代谢增加和有氧糖酵解(Warburg效应)[7]。谷氨酰胺酶通过催化谷氨酰胺生成谷氨酸,提高谷氨酰胺代谢,为肿瘤细胞增殖提供足够能量,促进肿瘤的发生发展[8]。多数肿瘤细胞中肾型谷氨酰胺酶(Kidney-type glutaminase,GLS1)显著高表达,在细胞谷氨酰胺代谢及肿瘤生长中意义显著[9]。因此,本研究拟探究miR-203a-3p和GLS1对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响及其调控作用机制,旨在为临床HCC诊疗提供更多参考。

1 材料与方法

1.1 研究对象 HCC细胞系HepG2,HCCLM3,Huh7,Hep3B和人正常肝细胞株LO2购自中国科学院,37℃,5ml/dl CO2条件下培养在含10g/dl胎牛血清、1g/dl链霉素和青霉素的DMEM培养液中。另选取2021年7~8月由沧州中西医结合医院病理科留存的20例HCC患者癌组织及对应癌旁正常组织样本,均由术中获取经病理确诊后-80℃低温液氮保存;未并发其他恶性肿瘤,术前无相关放化疗及新辅助治疗史。

1.2 试剂和仪器 胎牛血清、链霉素、青霉素(四季青生物科技公司);DMEM培养液、胰蛋白酶(武汉博士德生物科技有限公司);TRIzol试剂、Lip 2000转染试剂(美国Invitrogen公司);逆转录试剂盒(Aidlab公司);CCK-8试剂盒,双重荧光素酶活性测定(Promega公司);Transwell小室(美国BD Biosciences公司);酶标仪(美国Bio-rad公司);实时荧光定量PCR仪(美国ABI公司);β-catenin,p-GSK-3β,c-Myc抗体(Bio-RAD 公司);谷氨酰胺代谢产物检测试剂盒(北京索莱宝科技有限公司);miR-203a-3p mimic模拟物、miR-203a-3p inhibitor抑 制 物 及GLS1-3'UTR-wt野生型和3'UTR-mut突变型荧光质粒(广州锐博生物科技有限公司);谷氨酰胺酶特异性小分子抑制剂968,沉默GLS1表达siRNA载体(上海吉玛基因生物)。

1.3 方法

1.3.1 细胞转染及分组:取生长密度达80%时的待测细胞,参照Lipo 2000说明书进行转染,分组为 miR-203a-3p过表达组(mimic组),miR-203a-3p过表达阴性组(mimic-NC组),miR-203a-3p低表达组(inhibitor组),miR-203a-3p低表达阴性组(inhibitor-NC);GLS1抑制组(转染谷氨酰胺酶抑制剂968),GLS1敲低表达组(siRNA组),GLS1敲低阴性对照组(siRNA-NC)。转染完成后常规培养48 h,行后续实验。

1.3.2 qRT-PCR检测目的基因表达:采用TRIzol试剂提取细胞、组织总RNA,反转录为cDNA,以此为模板配置PCR反应体系,2×SYBR Green Master Mix 5 μl,正 反 向 引 物 各2.5 μmol/L,cDNA 1 μl,无Rnase双蒸水,总体积20 μl;利用实时荧光定量PCR仪进行qRT-PCR扩增反应,反应条件:95℃ 35 s,95℃ 20 s,72℃15 s,循环40次。采用2-ΔΔCt法计算目的基因mRNA表达。引物序列见表1。

表1 PCR引物序列

1.3.3 细胞增殖能力检测:收集待测细胞接种到96孔板,密度1×104/孔,37℃,5%(v/v)CO2孵育48 h,每孔加入CCK-8溶液10 μl,孵育72 h,450 nm处用酶标仪测量吸光度A值,绘制增殖曲线,每孔设3个复孔,实验重复3次取平均值。

1.3.4 细胞迁移能力检测:收集待测细胞接种到6孔板,密度4×106/孔,待生长铺满底板,10 μl枪头垂直孔板划痕,PBS冲洗3次,去掉划痕碎片,加入无血清培养基培养48 h,拍照观察分析。

1.3.5 细胞侵袭能力检测:Transwell小室上室底部铺Matrigel基质胶,室温晾干;取对数生长期待测细胞,胰酶消化,重悬,调整浓度1×105/ml;下室加入含10g/dl胎牛血清DMEM完全培养液500μl,上室加入细胞悬液200 μl,培养24 h;取出小室,吸干培养液,4g/dl多聚甲醛固定20 min,0.1g/dl结晶紫染色15 min,PBS冲洗2次,去除上室多余细胞,晾干,倒置显微镜下观察细胞数量。

1.3.6 Western blot检测Wnt/β-catenin通路关键蛋白表达:取待测细胞裂解提取总蛋白,BCA法检测浓度;取蛋白样品行SDS-PAGE电泳分离,转移到PVDF膜,5g/dl脱脂奶粉封闭2 h,PBST洗膜2次,加入β-catenin,p-GSK-3β,c-Myc一抗(1∶1 000)孵育过夜;次日洗膜后加入二抗,室温孵育2 h,PBST洗膜3次,ECL化学显色,凝胶成像系统观察拍照,Image-J 软件行灰度值定量分析。

1.3.7 双荧光素酶报告基因实验:取各组细胞接种到6孔板,将GLS1野生型和突变型3'UTR区序列插入双荧光素酶报告基因质粒,后将包含miR-203a-3p结合位点在内的GLS1-3'UTR-WT野生型和3'UTR-Mut突变型荧光素酶报告质粒与miR-203a-3p mimic共染至待测细胞中培养48 h,使用荧光素酶活性测定试剂盒检测各组荧光素酶活性,实验重复三次取平均值。

1.3.8 生物信息学预测分析:利用TargetScan (http://www.targetscan.org/) 网站预测与miR-203a-3p存在结合位点的可能靶基因,并通过双荧光素酶报告基因实验验证两者的结合关系。

1.3.9 谷氨酰胺饥饿实验:取待测细胞按1×105个/孔接种在12孔板,待细胞贴壁后,分别用含/不含谷氨酰胺的DMEM培养液培养0,2,4,6天并计数,每隔一天更换一次培养液,绘制生长曲线,实验重复三次取平均值。

1.3.10 GLS1酶活性测定:采用线粒体提取试剂盒提取分离细胞得到线粒体,采用两步法进行酶活性检测;按说明书配制第一步反应液,将线粒体提取物加入其中,37℃旋转孵育1 h,加入HCl终止反应;配制第二步反应液,将其与终止反应的第一步反应液混合,室温孵育45 min,340 nm处以去离子水作为空白,测定最终吸光度值。

1.3.11 谷氨酰胺代谢检测:①α-酮戊二酸(α-Ketoglutaric acid,α-KG)检测:取待测细胞制成细胞悬液,处理去除悬液中存在的各类酶类;96孔板每孔加入50μl相应反应混合液,37℃避光反应30 min,570 nm处用酶标仪检测各孔吸光度值,绘制标准曲线,计算各组α-KG含量。②谷氨酸检测:取待测细胞同样制成细胞悬液,离心,吸去上清,吹打混匀,离心,弃上清液;重悬细胞,计数,超声破碎仪破碎细胞,离心,留取上清待测;按照检测试剂盒说明书检测计算各组细胞中谷氨酸含量。

1.4 统计学分析 采用软件SPSS 19.0进行数据分析,数据采用均数±标准差(±s)表示,两组间比较采用独立样本t检验;多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD 检验;癌组织及癌旁组织中差异比较采用配对t检验。P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 HCC组织及细胞中miR-203a-3p表达 qRTPCR检测显示,HCC癌组织中miR-203a-3p表达(0.32±0.07)明显低于癌旁正常组织(1.02±0.03),差 异 有 统 计 学 意 义(t=41.105,P<0.001);HCC细 胞HepG2(0.34±0.05),HCCLM3(0.58

±0.06),Huh7(0.43±0.05),Hep3B(0.29±0.04)中miR-203a-3p相对表达水平亦明显低于人正常肝细胞LO2(1.01±0.02)中miR-203a-3p表达水平,差异有统计学意义(F=119.080,P<0.001),其中Hep3B细胞表达最低,故选择该细胞用于后续实验。

2.2 miR-203a-3p对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响 见表2。 qRT-PCR 检测显示,与Blank组(1.01±0.02)相比,miR-203a-3p 过表达组细胞中miR-203a-3p相对表达(2.32±0.14)明显升高,miR-203a-3p 低表达组细胞中miR-203a-3p相对表达(0.26±0.05)明显降低,差异有统计学意义(t=16.044,24.123,均P<0.001),提示过表达/敲降miR-203a-3p细胞系构建成功。细胞实验检测显示,miR-203a-3p过表达组Hep3B细胞增殖、迁移率和侵袭能力较对照组明显抑制,组间差异具有统计学意义(t=14.849,13.900,10.562,均P<0.001);反之敲降miR-203a-3p表达组细胞增殖、迁移和侵袭能力明显增加,组间差异具有统计学意义(t=10.135,8.995,9.577,均P<0.001)。提示HCC中miR-203a-3p扮演抑癌基因作用。

表2 miR-203a-3p表达对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响(±s)

表2 miR-203a-3p表达对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响(±s)

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2.3 miR-203a-3p靶基因的预测及验证 生物信息学数据库检索显示,miR-203a-3p与GLS1 3'UTR区存在结合位点,见图1。通过构建GLS1 3'UTR-野生型和突变型质粒,经双荧光素酶基因报告实验 验 证 发 现,转 染miR-203a-3p mimic组GLS1 3'UTR-WT型质粒荧光活性较转染mimic-NC组明显降低(0.43±0.05 vs 1.02±0.01),差异有统计学意义(t=20.041,P<0.001);转染miR-203a-3p mimic组GLS1 3'UTR-Mut型质粒荧光活性与转染mimic-NC组(0.98±0.03 vs 1.01±0.01)未见明显变化,差异无统计学意义(t=1.643,P=0.176),表明GLS1是miR-203a-3p的靶基因。进一步检测 发 现,miR-203a-3p mimic组(0.34±0.08)中GLS1表达较Blank组(1.01±0.02)明显降低,差异有统计学意义(t=14.073,P<0.001);敲降miR-203a-3p inhibitor组(1.96±0.14)中GLS1表达较Blank组(1.01±0.02)明显升高,差异有统计学意义(t=11.635,P<0.001),提示miR-203a-3p靶向负调控GLS1表达。

图1 生物信息学网站检索miR-203a-3p的靶基因

2.4 HCC细胞对谷氨酰胺的依赖性 见图2。谷氨酰胺饥饿实验显示,在含谷氨酰胺的培养基中Hep3B和LO2细胞持续生长,但LO2生长缓慢;在不含谷氨酰胺的培养液中Hep3B细胞生长明显抑制,LO2细胞生长不受影响。表明HCC细胞对谷氨酰胺存在明显的依赖性。

图2 HCC细胞对谷氨酰胺的依赖性

2.5 HCC细胞中GLS1表达及活性 qRT-PCR检测显示,HCC细胞HepG2(2.54±0.04),HCCLM3(2.02±0.03),Huh7(1.76±0.05),Hep3B(2.26±0.04)中GLS1相对表达水平明显高于人正常肝细胞LO2中GLSI表达水平(1.01±0.01),差异有统计学意义(F=763.254,P<0.001)。酶活性测定结果显示,HCC细胞HepG2(2.31±0.05),HCCLM3(1.57±0.03),Huh7(1.42±0.04),Hep3B(2.25±0.03)中GLS1酶活性明显高于人正常肝细胞LO2(1.00±0.01),差异有统计学意义(F=787.125,P<0.001),尤以HepG2、Hep3B细胞表达最为显著,表明HCC细胞中GLS1高表达呈现高酶活性。

2.6 抑制GLS1抑制HCC细胞谷氨酰胺代谢 qRTPCR检测显示,与Blank组(1.01±0.02)相比,转染siRNA1-GLS1(0.37±0.06),siRNA2-GLS1(0.44±0.05)和siRNA3-GLS1(0.21±0.03)载体组细胞中GLS1相对表达明显降低,差异有统计学意义(F=197.014,P<0.001),其中siRNA3组降低最显著。Western blot实验检测显示,GLS1抑制组中GLS1蛋白(0.28±0.03)表达较Blank组(1.00±0.01)和阴性对照DMSO组(0.98±0.02)明显降低,差异有统计学意义(F=1 080.857,P<0.001),见图3,证实GLS1表达抑制有效。研究检测各组细胞内谷氨酰胺代谢产物水平发现,转染siRNA-GLS1后,Hep3B细胞中α-KG和谷氨酸水平均较对照组明显降低,差异有统计学意义(t=10.387,7.381,均P<0.001),见表3。

图3 Western blot检测加入抑制剂968对GLS1蛋白表达的影响

表3 抑制GLS1对HCC细胞谷氨酰胺代谢产物表达水平的影响(±s)

表3 抑制GLS1对HCC细胞谷氨酰胺代谢产物表达水平的影响(±s)

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2.7 miR-203a-3p靶向GLS1对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响 见表4。细胞实验检测显示,GLS1抑制组Hep3B细胞增殖、迁移、侵袭能力较对照组明显降低,差异均有统计学意义(t=16.499,16.278,11.215,均P<0.001);在miR-203a-3p inhibitor组共转染抑制GLS1表达后,miR-203a-3p对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的作用被逆转,inhibitor组、inhibitor+ siRNA组与Blank组比较,差异均有统计学意义(t=10.371,16.482,10.418;4.950,13.190,4.808,均P<0.001)。

表4 miR-203a-3p调控GLS1对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响(±s)

表4 miR-203a-3p调控GLS1对HCC细胞增殖、迁移、侵袭的影响(±s)

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2.8 miR-203a-3p靶 向GLS1对Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白的影响 Western blot检测显示,miR-203a-3过表达组和GLS1抑制组β-catenin,p-GSK-3β,c-Myc蛋白表达水平较对照组明显降低,差异有统计学意义(t=14.184,25.828,22.323;11.129,28.213,22.961,均P<0.001);GLS1抑 制 组β-catenin,p-GSK-3β,c-Myc蛋白表达水平较siRNA+ inhibitor组明显降低,差异有统计学意义(t=9.602,18.676,16.902,均P<0.001)。在抑制GLS1表达组共转染miR-203a-3p inhibitor后,Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白表达水平被逆转恢复,见图4和表5,说明miR-203a-3p通过靶向GLS1调控Wnt/β-catenin信号通路活性参与HCC的发生发展。

表5 miR-203a-3p调控GLS1对Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白的影响(±s)

表5 miR-203a-3p调控GLS1对Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白的影响(±s)

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图4 miR-203a-3p和GLS1对Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白的影响

3 讨论

近年发现,多种非编码RNA在疾病的发生发展中具有重要调控作用,得到临床广泛关注[2-3]。研究表明,miRNA主要参与基因转录后水平,可通过多种方式和途径调节细胞的分化、代谢及侵袭转移等过程[3]。不同miRNAs在不同肿瘤中的表达调控作用及调控的下游靶基因也不同,既可以发挥原癌基因作用,也可发挥抑癌基因作用,进而影响不同信号通路的激活或抑制,参与调节疾病的发生,是新的肿瘤分子标记物及治疗靶点[10]。

研究表明,miR-203a-3p在多种肿瘤中表达下调,被认为是肿瘤抑制因子。如研究报道,胃癌中miR-203a-3p靶向胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)发挥抑癌作用,参与调控了胃癌细胞的增殖及细胞周期[4]。MiR-203a-3p通过调节SLUG抑制胰腺癌细胞增殖、上皮细胞-间充质转化(EMT)和凋亡[6]。MiR-203a-3p通过靶向ATM介导Akt/GSK-3β/Snail信号通路,调控卵巢癌细胞的增殖、迁移、凋亡等生物学行为[11]。结直肠癌[12]、非小细胞肺癌(NSCLC)[5]等肿瘤细胞中也发现miR-203a-3p表达异常,参与了疾病的发生发展,表现出原癌或抑癌基因属性。本研究发现,HCC组织、细胞中miR-203a-3p表达下调,细胞实验发现miR-203a-3p过表达能够抑制HCC细胞的增殖、迁移和侵袭,提示miR-203a-3p发挥抑癌基因作用,与陈昶舟等[13]研究结果一致。

研究利用生物信息学分析证实GLS1是miR-203a-3p的目标靶基因,miR-203a-3p靶向负调控GLS1。研究表明,基因改变、能量代谢变化及局部微环境改变对肿瘤的发生发展至关重要[14]。对细胞能量代谢的研究表明,谷氨酰胺和葡萄糖是肿瘤的主要能量来源,癌细胞能量代谢除了表现出Warburg效应外,细胞对谷氨酰胺的利用速度远超于其他氨基酸,提示谷氨酰胺依赖是肿瘤细胞能量代谢的关键[14]。并有研究指出,谷氨酰胺代谢过程中,谷氨酰胺通过谷氨酰胺酶催化转化为谷氨酸,谷氨酸在转氨酶作用下又转化生成α-酮戊二酸(α-KG)、谷胱甘肽等重要生化代谢中间产物,为肿瘤细胞提供能量,降低活性氧(ROS)水平,维持细胞氧化还原[15]。谷氨酰胺酶表达下调时细胞氧耗减少,相关性ATP及谷胱甘肽水平下降,ROS水平增高,细胞凋亡增加[16]。多种肿瘤细胞内谷氨酰胺代谢异常,谷氨酰胺酶在谷氨酰胺代谢过程中至关重要[17]。另有研究报道,GLS1催化谷氨酰胺转化介导肿瘤细胞能量代谢,参与了多种肿瘤的EMT及侵袭、耐药[17]。GLS1通过降低ROS水平调节细胞抗氧化防御,维持了细胞的氧化还原稳定性[18]。MiR-23a通过靶向GLS1可调控H2O2诱导的视网膜色素上皮细胞的增殖和迁移[19]。而本研究发现,HCC细胞生长对谷氨酰胺高度依赖,HCC细胞中GLS1高表达呈现高酶活性,抑制GLS1表达后谷氨酰胺代谢抑制,提示GLS1高酶活性表达,细胞谷氨酰胺代谢增强,促进了HCC细胞的生长及恶性进展。同时还发现,抑制GLS1表达后HCC细胞增殖、迁移和侵袭能力被抑制,GLS1能够逆转miR-203a-3p对HCC细胞生物学的作用,提示miR-203a-3p可通过靶向GLS1参与调节HCC细胞的生物学行为,由GLS1介导的谷氨酰胺依赖可能是HCC的潜在治疗靶点。

相关信号通路的激活或失活是肿瘤基因发挥作用的重要途径,Wnt/β-catenin信号通路参与调控细胞的生长、分化及凋亡,其失调被认为是引起人类恶性肿瘤发生进展的启动因素[20]。现有研究表明,谷氨酰胺能激活重要的信号转导通路,介导维持细胞的存活和增殖,参与调控肿瘤的发生、转移及耐药,发现Wnt/β-catenin信号通路可以介导调节肿瘤细胞代谢,影响ROS表达调节,参与肿瘤进展[21-22]。Wnt通路相关Myc基因异位表达能增加谷氨酰胺酶的表达,促进细胞谷氨酰胺代谢,促进肿瘤细胞对谷氨酰胺的依赖性[9]。此外,ZHAO等[24]研究报道,肾癌中c-Myc通过增强GLS1表达可促进谷氨酰胺降解;QING等[25]研究也表明,神经母细胞瘤中ATF4调节Myc介导肿瘤细胞谷氨酰胺剥夺,促进细胞死亡。基于此本研究经探究miR-203a-3p调控GLS1对Wnt/β-catenin通路活性的影响,显示miR-203a-3过表达和抑制GLS1表达均能使Wnt/β-catenin通路失活,而miR-203a-3p低表达能够逆转GLS1对该通路的抑制作用。本研究结果表明,miR-203a-3p可能通过靶向GLS1调控Wnt/β-catenin信号通路活性参与HCC的发生发展。然肿瘤发生发展的作用机制复杂,miR-203a-3p靶向GLS1调控HCC发生进展的分子作用还需进一步继续探究。

综上所述,MiR-203a-3p过表达能够抑制HCC细胞的增殖、迁移和侵袭,可能与GLS1调控细胞内谷氨酰胺代谢及miR-203a-3p靶向GLS1调控Wnt/β-catenin信号通路活性有关。

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