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某部驻训期间发热呼吸道综合征病原谱监测分析

2022-08-05王晓芹浮飞翔佟宇浩

武警医学 2022年7期
关键词:病原检出率阳性

王晓芹,浮飞翔,于 畅,刘 锦,佟宇浩,汤 芳

病毒性呼吸道感染是指由多种病毒引起的急性呼吸道感染(acute respiratory trac tinfection,ARTI)总称,引起病毒性呼吸道感染的病原体种类较多,如流感病毒(influenza viruses, IFV)、人副流感病毒(human parainfluenza viruses, HPIV)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus, RSV)、人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)、人偏肺病毒(human metapneumovirus,HMPV)、人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)、人腺病毒(human Adenovirus, HAdV)、人冠状病毒(human Coronavirus, HCoV)等。本研究拟对某部驻训期间发热呼吸道综合征(febrile respiratory syndrome, FRS)患者进行病毒性呼吸道感染病原学监测,以了解致病病原体种类和发病规律,为开展部队ARTI的临床诊断和预防控制提供科学依据。

1 对象与方法

1.1 对象 采用重大传染病防治科技重大专项传染病监测平台《发热呼吸道综合征监测技术方案》中的FRS病例定义:(1)急性感染表现(至少符合下列任何一项),发热(从发病开始有报告和记录),WBC升高或降低或WBC分布异常,寒颤,体温降低(考虑年龄);(2)呼吸道临床表现(至少符合下列任一项),咳嗽(新发或咳嗽加重),咳痰,气短,听诊呼吸音异常(湿啰音、干啰音、哮鸣音、浊音),呼吸急促,胸痛;(3)胸部X线片提示肺部炎性改变(如肺部片状阴影或肺实变影等)。本研究将某部驻训期间(2019年8-11月)符合FRS患者定义的人群共101例纳入调查对象,该部驻地为南部沿海地区,属于亚热带季风气候,夏季高温多雨,冬季温和少雨。

1.2 调查方法 采用回顾性调查和现场流行病学调查方法,由专业流调人员对FRS病例进行面对面的问卷调查,内容包括:(1)基本人口统计学信息特征:年龄、性别、籍贯、部别等;(2)流行病史:调查对象与FRS患者的密切接触史、外出史等;(3)临床症状与检查:发热、咳嗽、寒颤、流涕、咽痛、乏力、肌肉酸痛、呼吸困难、腹泻等临床症状;(4)药物治疗史:药物名称、用法、用量、疗程;(5)疫苗接种史:疫苗种类、接种时间。

1.3 检测方法 在标本采集、运输及实验室工作过程中,均按照《病原微生物实验室生物安全管理条例》等相关规定,做好生物安全工作。

1.3.1 主要试剂与仪器 咽拭子标本采集系统(BD Universal Viral CulturetteTM Transport System);核酸提取试剂盒(QIAampMiniElute Virus Spin DNA/RNA kit,Qiagen);逆转录试剂盒(SuperScript Ш RT,Invitrogen);引物、探针(上海生工公司);PCR扩增仪(Eppendorf);实时定量PCR扩增仪(7500,ABI)。

1.3.2 标本采集 采集101例FRS患者的临床标本。用拭子擦拭咽后壁及扁桃体隐窝、侧壁等处,反复擦拭3~5次,收集黏膜细胞,立即送检。血液标本:使用真空EDTA抗凝管和非抗凝管采集血液标本各5 ml,存放于-80 ℃冰箱待测。

1.3.3 标本处理 (1)咽拭子标本处理:在安全柜内打开咽拭子管盖,用灭菌止血钳夹住拭子枘,搅拌数次并挤出棉拭子上的液体,保证细胞充分脱落,提高检出率,并分装管中用于核酸检测的标本。(2)血液标本处理:抗凝血提取外周血单个核细胞(PBMC),-80 ℃冻存备用;非抗凝血进行血清分离、分装,-80 ℃冻存备用。

1.3.4 核酸检测 RNA病毒检测采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)方法,将RNA反转录为cDNA,DNA病毒检测采用PCR方法。将核酸(RNA或DNA)分别进行IFV(IFV-A、IFV-B和IFV-C)、HPIV(HPIV-1、HPIV-2、HPIV-3和HPIV-4)、HRV、RSV(RSV-A和RSV-B)、HMPV、HBoV、HAdV、HCoV(HCoV-229E、HCoV-OC43 HCoV-HKU1和HCoV-NL63)检测。操作方法按照试剂盒说明书及实验室标准化流程(SOP)操作。

1.4 统计学处理 采用SPSS 25.0软件进行数据处理,计数资料采用%表示,不同组别之间的差异比较采用检验,<0.05为差异有统计学意义。

2 结 果

2.1 基本情况 共纳入FRS病例101例,均为男性,年龄18~45岁,平均(22.81±4.26)岁,其中18~29岁97例(96.04%),战士98例(97.03%),干部3例 (2.97%)。

2.2 病原检测情况 101例FRS咽拭子标本中,检出病毒阳性标本37例,阳性率为36.63%,其中IFV阳性率最高26.73%(27例),其后依次为HPIV 3.96%(4例)、RSV 2.97%(3例)、HRV 2.97%(3例)、HMPV 1.98%(2例);HBoV、HAdV、HCoV均未检出阳性标本。27例IFV阳性标本中,IFV-B 26例,IFV-A H3N2 1例。4例HPIV阳性标本中,HPIV-3 3例,HPIV-11例。3例RSV阳性标本均为RSV-A。37例阳性标本中,2例标本存在混合感染,检出率为5.41%,分别为IFV-B和RSV、IFV-B和HRV混合感染。

2.3 临床症状情况 101例FRS病例中,均出现发热症状(≥37.5 ℃),平均体温(38.4±0.50)℃,均未出现腹痛、腹泻、呕吐等消化道症状,无重症病例报道。部分病例伴有咽痛(28.71%)、咳嗽(28.71%)、头痛(35.64%)、乏力(49.50%)、咳痰(14.85%)、寒颤(21.78%)、流涕(23.76%)、肌肉酸痛(38.61%)、扁桃体肿大(12.87%)等症状,且咳嗽(=26.968,=0.000)、咽痛(=26.968,=0.000)、乏力(=12.865,=0.000)、头痛(=17.901,=0.000)、肌肉酸痛(=10.704,=0.001)5种症状在阳性病例组与阴性病例组间差异具有统计学意义(表1)。

3 讨 论

FRS是一组以发热、咳嗽、咳痰、寒颤等具有相似临床症状和体征的呼吸系统疾病,其中ARTI是人类最常见的传染性疾病之一,90%以上的ARTI是由病毒引起的。病毒性呼吸道感染具有发病率高、传染性强、传播速度快、流行范围广、病原体不断变化的特点,感染率在不同国家或地区、不同时间或季节、不同人群中分布特征有所不同,特别是一系列新发现的病原体也被认为与ARTI相关,如SARS-CoV2、MERS-CoV、H7N9禽流感和SARS-CoV等,疾病的迅速传播给人类健康和世界经济造成巨大负担。部队是一个特殊群体,由于人群聚集性、流动性、多元性等特点,很容易发生疫情并造成区域性暴发流行。因此,开展驻训部队官兵呼吸道感染病原学监测,对提高部队战斗力具有重要意义。

3.1 FRS病例临床特点分析 本研究结果显示,FRS所有病例均有发热症状,以咳嗽、咽痛、头痛、乏力、肌肉酸痛等症状为主,与病原检测阴性病例相较,病原阳性病例更容易出现上述症状,提示病原诊断不明确时,加强对症治疗是有效和必要的。由于不同病原所致的ARTI临床症状相似,对于阴性病例可重复检测或扩大病原谱检测范围,寻找感染病原,为鉴别诊断、临床救治和预防控制提出针对性更强的建议。

3.2 FRS病例病原谱监测分析 本研究结果显示,101例FRS病例标本中,呼吸道病毒阳性检出率为36.63%,主要优势毒株与驻地流感监测结果一致。纵观全国FRS调查显示,IFV也是引起我国大部分地区FRS最常见的病毒性病原体和呼吸道感染的主要原因。IFV感染病例在严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection, SARI)病例数中约占13%,IFV高峰期有47%的SARI病例为IFV感染者。我国IFV具有明显地域性、季节性特征,南方地区存在春季、夏季和冬季三个流行高峰,北方地区存在春季、冬季两个流行高峰,优势病毒株为IFA-H3N2、IFA-H1N1、IFB周期性更替流行或共同流行。部队ARTI病原学检测发现,呼吸道病毒阳性检出率为14.79%~44.81%,其中以IFB、IFA、HAdV检出率最高。国家CDC对ARTI病原学监测表明,呼吸道病毒阳性检出率为34.8%,其中IFV检出率最高34.8%,5岁以下儿童最高46.9%,5~17岁降至30.2%,成年为26.9%,老年25.1%。冯录召在ARTI住院病例中检测发现,IFV是成年和老年人群的优势病原,RSV是2岁以下儿童最常见的病毒性病原,年龄组越小,病毒多样性越明显。

3.3 FRS病例监控及预防建议 基于本次调查,提出以下建议:(1)在部队集训时,要及时掌握驻地地理环境、气候条件及疾病流行情况,监测分析训练期间可能出现的FRS疫情,加强卫生防疫力量配置,严格落实体温监测、疫情报告、消毒隔离、预防用药等制度,提高呼吸道传染病防控意识和能力;(2)新兵入伍后,训练强度较大,生活作息紧张,心理负担较重,对驻地气候条件及环境不适应,是呼吸道传染病防控重点人群,应该加强对新兵健康宣教,采取预防性措施;(3)出现FRS集中暴发时,建议采用高通量检测技术和宏基因组测序技术等检测方法以便更全面地检测呼吸道病原菌,如低热者发病3~6 d内采集标本可能更有利于病原体的检出,更有利于达到防控呼吸道传染病、指导临床用药及预测预警目的。

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