刘青， 周书玉， 崔冬丽， HESLOP HARRISON John Seymour

1. 中国科学院 植物资源保护与可持续利用重点实验室/中国科学院 华南植物园， 广州 510650；2. 中国科学院 核心植物园， 广州 510650； 3. 中国科学院大学， 北京 100049；4. 莱斯特大学 遗传学和基因组生物学系， 英国莱斯特 LE1 7RH

病毒粒子是一种由核酸和蛋白质外壳组成的细胞内寄生病原物， 具有生长、 遗传和变异等生物特性和侵染活性[1]． 植物病毒寄生引起植物病毒病， 被人们称为“植物癌症”． 国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses， ICTV)第10次病毒分类报告(2017年第10版)中， 病毒分类系统包括9目、 131科、 46亚科、 802属和4 853种， 其中侵染植物的病毒有5目、 28科、 5亚科、 121属、 1 440种， 与ICTV第9次病毒分类报告相比， 病毒种类增加了3目、 44科、 27亚科、 453属、 2 569种[2]． 通过宏基因组测序获得丰富的基因组信息， 并运用到病毒分类和命名， 该技术获得ICTV的认可． 2017版病毒分类系统中病毒数量倍增的根本原因， 在于大范围取样和宏基因组测序的应用[3]． 宏基因组测序则是利用HTS技术直接对环境中所有微生物进行测序， 真实客观地检测环境中存在的病毒， 因此， HTS技术的发展在病毒检测和分类中发挥关键作用． 近年来， 蔬菜、 粮食、 果树等均有被新病毒侵染的报道， 2020年， 农业农村部公布的《一类农作物病虫害名录》中包括7种病害， 其中南方水稻黑条矮缩病的病原体为南方水稻黑条矮缩病毒(southern rice black-streaked dwarf virus， SRBSDV)[4]， 病害严重影响着作物的产量和品质． 农药和化肥的过度使用、 全球变暖以及环境的恶化， 加剧了植物病毒的传播和发展， 而治理植物病毒病的前提是建立有效的植物病毒检测方法．