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一种用于PCR的丝状真菌DNA快速粗提方法

2022-06-08李明晨李跃李敬涛梁文星刘思慧

青岛农业大学学报(自然科学版) 2022年2期
关键词:利用检测方法

李明晨,李跃,李敬涛,梁文星,刘思慧

(1.青岛农业大学植物医学学院/山东省植物病虫害综合防控重点实验室,山东青岛 266109;2.青岛农业大学理学与信息技术学院)

随着分子生物学的发展,对于病原菌的研究上升到分子水平。在对丝状真菌进行分子生物学鉴定时,离不开分离基因组DNA,但研究目的不同,对DNA的质量要求也不同。目前提取DNA的方法主要有CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法、微波法、SDS(十二烷基硫酸钠)法、尿素法、乙酸铵法等[1-4],其中CTAB提取法可以稳定高质量的提取基因组DNA[2-3]。但当需要提取的DNA样品份数较多时,经典的CTAB提取法步骤繁琐,时间长,效率较差,而且采用有机试剂反复抽提,具有一定的安全隐患[5]。有些研究对DNA的提取质量要求不高,微量DNA就可通过PCR扩增达到试验目的[6]。Zou等[7]开发了一种试纸条快速提取纯化DNA的方法,但目前还未商业化开发,所用试纸条也需要特殊处理,且在高通量筛选转化子时,是否会存在提取纯化DNA不稳定的情况从而影响检测结果也有待确定。因此在实验室条件下,探索一种快速、便捷、稳定、高效地粗提DNA方法仍然十分有必要。

利用NaOH可以使细胞处于强碱环境下,使细胞裂解暴露DNA,通过高速离心除去蛋白等杂质,取上清液以TE缓冲液中和,提供缓冲环境,防止核酸被破坏。例如,利用碱裂解法可以提取细菌质粒DNA[8],同时,碱裂解法也可以提取植物基因组DNA[2-3,5]。本研究比较了利用NaOH及CTAB提取DNA流程的异同,用两种不同提取方法对丝状真菌尖孢镰刀……

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