0 引言

肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)较为常见的消化系统恶性肿瘤.流行病数据预计,2021年全球范围内HCC每年新发病例为905677例,因HCC死亡病例为830180例

目前大多数研究认为HCC的发生主要与乙肝肝硬化有关,HBV感染后造成肝细胞的持续损伤、修复、再损伤循环,从而造成肝硬化,继而发生癌变,但其确切发病机制不清

大多数研究认为多基因的时空表达失调与HCC的发生密切相关

,但涉及HCC有关的时空表达失调的基因众多,不同的差异表达基因在HCC发生发展及侵袭转移等生物学过程中可能发挥不同的作用.现有的HCC发生及生物学行为相关基因有Tp53,Bcl-2,Bad-p,Bax

,HULC和H19等

上述基因大多被相关文献报道,而HCC差异表达基因集及其相关的生物学功能、与预后的关系和诊断价值鲜有报道.

1 材料和方法

1.1 材料 研究采用生物信息数据库分析,首先在基因综合表达数据库[(gene expression omnibus,GEO)中筛选HCC与正常肝组织基因表达数据,然后对数据集中的差异表达基因进行筛选,对筛选出的差异基因进行基因本体论(gene ontology,GO),基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)和聚类分析.对差异基因进行关键基因(hub基因)鉴定.Kaplan-Meier数据库对比关键基因高低表达与HCC患者预后关系.同时,采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)以hub基因为参考,诊断HCC的价值,图1.

研究选取(GEO,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)、(KEGG,https://www.genome.jp/kegg/pathway.html)、蛋白互相作用拓扑网络数据库(STRING,http://string-db.org/cgi/input.pl)、肿瘤生存分析数据库(Kaplan-Meier,http://kmplot.com/analysis/index.php?p=service),作为本次研究的主要数据来源.

针对高校服务器的分布特点，本文设计的基于Elasticsearch 的校内全文搜索引擎的总体架构如图1所示，其核心组件包括爬虫模块、索引模块以及检索模块。……