赵凌，张勇，魏晓东，梁文化，赵春芳，周丽慧，姚姝，王才林，张亚东

利用高密度Bin图谱定位水稻抽穗期剑叶叶绿素含量QTL

赵凌，张勇，魏晓东，梁文化，赵春芳，周丽慧，姚姝，王才林，张亚东*

江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心，南京 210014

【目的】挖掘新的控制水稻叶绿素含量的相关位点和基因，为水稻叶绿素含量的遗传机制研究提供理论基础。【方法】利用剑叶叶色存在明显差异的粳稻TD70和籼稻Kasalath杂交构建的包含186个株系的重组自交系群体为供试材料，通过对两亲本及RIL群体重测序，构建了包含12 328个Bin标记的高密度遗传图谱。RIL群体及亲本分别于2011和2020年正季在江苏省农业科学院种植。抽穗后第3天使用叶绿素仪测定剑叶SPAD值。使用IciMappingv3.4软件完备区间作图法，对控制水稻抽穗期剑叶叶绿素含量的QTL进行鉴定。利用便携式光合仪测定RIL群体中20个SPAD极端株系的水分利用效率、蒸腾速率、气孔导度和净光合速率等光合作用参数。【结果】2年共检测到19个抽穗期剑叶叶绿素含量相关QTL，分别分布在除第8、9和10染色体外的其他9个染色体上。单一QTL贡献率为3.09%—13.13%，LOD值为2.74—14.08。通过物理位置比对，发现其中10个QTL与前人定位到的叶绿素含量相关位点在相同或邻近区域。和2年均被检测到，表现出较强的稳定性。位于第2染色体的7.63—7.71 Mb处，2年LOD值分别为14.08和7.93，贡献率分别为13.13%和7.94%。位于第5染色体的23.44—23.49 Mb处，2年LOD值分别为4.31和3.76，贡献率分别为3.57%和4.82%。结合功能注释和亲本间序列分析，分别在和染色体区间内找到2个与剑叶叶绿素含量相关的基因和。……