望春玉兰WRKY基因家族生物信息学分析
2022-01-21戴晓港刘景胜李淑娴
江苏林业科技 2021年6期
戴晓港, 刘景胜, 李淑娴
(南京林业大学林学院/南方杨树工程技术研究中心/江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室, 江苏 南京 210037)
植物在整个生命活动过程中会不断受到各种生物胁迫(如食草动物和害虫的啃食、病原体侵染)和非生物胁迫(如干旱、低温、高温、土壤高盐碱等)的影响,然而植物不能自由移动来躲避这些不利环境,因此在漫长的进化过程中,植物逐渐从形态、生理、细胞以及分子水平发生进化以应对这些不利环境条件。当植物受到胁迫时会产生相应的应答反应,相关基因、蛋白质和代谢产物构成复杂调控网络以应答相应的胁迫。转录因子作为反式作用因子可以与靶标基因启动子区域相应的顺式作用元件特异结合,从而调控相关基因的转录,在植物应答生物胁迫和非生物胁迫中具有举足轻重的作用[1]。WRKY转录因子是植物中的超级转录因子家族之一,其典型特征是在氨基酸N-端有保守的WRKYGQK结构域,在C-端含有C2H2或C2HC型锌指结构[2]。根据上述保守结构域数量和锌指结构类型可将WRKY转录因子分为3组:第I组包含2个WRKY结构域和C2H2型锌指结构;第II组含有1个WRKY结构域和C2H2型锌指结构;而第Ⅲ类是由1个WRKY保守结构域和C2HC型锌指结构组成[2]。大量研究表明,WRKY在调控植物生长发育、生物胁迫和非生物胁迫[3-4]、次生代谢等多种生物过程中起着重要的作用[5-6]。如木本鸡脚棉中GaWRKY1转录因子通过调控卡丁烯合酶-A的活性,从而参与棉酚等倍半萜烯类化合物的合成[5];……
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