柯萨奇病毒B组5型感染的人恶性胚胎横纹肌肉瘤细胞系lncRNA表达谱分析
2022-01-21滕培英师玉露
滕培英,李 静,师玉露,杨 帆,欧 霞,陈 伟
(昆明理工大学 医学院, 云南 昆明 650500)
柯萨奇病毒B组5型(Coxsackie virus group B type 5,CVB5)属小RNA病毒科肠道病毒属,无包膜,基因组为单股正链RNA[1]。CVB5是引起手足口病(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)的主要病原体之一,主要感染5岁以下婴幼儿,临床症状通常表现为发热,黏膜皮疹和疱疹等,病情严重者会导致无菌性脑膜炎和急性弛缓性麻痹等神经性并发症,乃至死亡。近年来,由CVB5感染导致的HFMD呈爆发流行趋势,对幼儿健康造成了严重威胁[2-4]。然而,目前尚无针对CVB5感染引起HFMD的有效治疗手段和预防措施。
长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)是转录本长度大于200个核苷酸且不具备蛋白编码功能的非编码RNA总称,具有导向、海绵、分子诱饵以及与蛋白质相互作用等多种生物学功能[5]。同时,越来越多的研究证明,lncRNA与病毒-宿主之间存在密切关系[6-7]。病毒感染宿主细胞后,可引起宿主编码lncRNA的差异表达,它们通过调控免疫信号通路、病毒基因组转录翻译和宿主细胞代谢产物等方式发挥了重要作用[8-9]。
LncRNA在肿瘤的研究中已有大量的报道应用,然而关于lncRNA与病毒-宿主相互作用机制研究尚处于起步阶段。因此,本研究通过分析CVB5感染人恶性胚胎横纹肌肉瘤细胞系RD(human malignant embryonic rhabdomyosarcoma cell line,RD),细胞中差异lncRNA表达谱,从而为深入研究lncRNA调控CVB5与宿主之间的相互作用提供科学依据。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 试剂:DMEM(Hyclone公司),RNAiso Plus、One Step PrimeScriptTMRT-PCR Kit(TaKaRa公司)。
1.1.2 细胞及病毒:人恶性胚胎横纹肌瘤肉瘤细胞系RD(中国科学院昆明细胞库)及CVB5病毒均由本实验室保存。RD细胞接种于含有10% FBS的DMEM完全培养基,37 ℃、5% CO2培养箱培养。
