基于数据库挖掘分析BUB1基因在卵巢癌中的表达及意义
2022-01-06马玉博张乃文刘晓雪任凤云
马玉博,张乃文,潘 博,刘晓雪,任凤云
(1.牡丹江医学院;2.牡丹江医学院附属红旗医院影像科,黑龙江 牡丹江 157011)
卵巢癌是世界上最致命的妇科恶性肿瘤之一,尽管其他妇科癌症的发病率较高,但卵巢癌的死亡率是位居女性生殖系统肿瘤第一位[1],对人类的健康造成较严重的危害。所以早发现、早诊断对卵巢癌的治疗显得尤为关键。BUB1是一种有丝分裂检查点丝氨酸/苏氨酸激酶,在染色体分离[2-3]及中肾细胞癌[4]、乳腺癌[5]的发生发展中均发挥着关键作用。但BUB1目前在卵巢癌的研究中相对较少。故本文利用多个在线数据库分析BUB1在卵巢癌中的表达,分析BUB1和免疫细胞浸润在卵巢癌中的作用及对卵巢癌病人预后的影响,为进一步研究BUB1在卵巢癌的发生发展及预后中的意义提供一定理论依据和参考。
1 材料与方法
1.1 BUB1在各种肿瘤中的表达ONCOMINE数据库能够提供正常组织和肿瘤组织中的基因差异表达,通过ONCOMINE数据库分析BUB1在各种肿瘤中的表达情况,筛选条件为:(1)gene:BUB1;(2)cancer type:Ovarian Cancer;(3)data type:mRNA;(4)analysis type:cancer vs normal analysis;(5)设置临界值为P<0.001,Fold Change>2,Gene Rank=Top10%,检索BUB1在各种肿瘤中的表达。
1.2 BUB1在卵巢癌中的表达及相关性分析
1.2.1 BUB1在卵巢癌与正常组织中的表达水平 利用GEPIA数据库分析BUB1在卵巢癌中的表达情况,筛选条件为:(1)Expression DIY:Box plot;(2)Gene:BUB1;(3)Datasets Selection:OV。其他设为默认值,据此分析BUB1在卵巢癌中的表达情况。
1.2.2 BUB1与关键基因的相关性分析 利用GEPIA数据库分析BUB1与关键基因的相关性分析,在数据库检索界面中输入检索条件:(1)correlation analysis;(2)gene A:BUB1,gene B:AURKA、DLGAP5、KIF2C、TPX2;(3)Dataset selection:OV。
1.3 BUB1与卵巢癌患者预后的关系利用Kaplan-Meier Plotter数据库检索分析BUB1的表达水平与卵巢癌患者预后的关系。……
