基于阿霉素治疗的胃癌中lncRNA表达谱的微阵列分析
2021-12-30刘子倩李哲王胤曾焕玉李培峰
刘子倩 李哲 王胤 曾焕玉 李培峰




摘要:
为了研究药物阿霉素作用前后胃癌细胞中lncRNA表达的变化,采用微阵列技术分析AGS细胞中lncRNA和mRNA的基因表达谱,运用基因本体(GO)分析和KEGG分析探究基因表达功能,通过实时定量PCR实验对添加DOX前后AGS细胞中具有功能的lncRNA表达水平进行分析。研究结果显示,添加DOX后的AGS细胞lncRNA和mRNA的表达出现显著异常,这与多种生物过程、细胞成分和分子功能有关。
关键词:
胃癌,长链非编码RNA,阿霉素,微阵列分析,实时定量PCR
中图分类号: R735.2
文献标志码:A
收稿日期:2021-04-19
基金項目:
国家自然科学基金海外青年基金(批准号:82050410450、81850410551)资助;山东省自然科学基金(批准号ZR2019BH014)资助。
通信作者:
曾焕玉(AUNG Lynn Htet Htet),女,博士,主要研究方向为利用高通量测序,生物信息学,细胞生物学方法研究衰老及心脑血管疾病的机理机制;李培峰,男,博士,教授,主要研究方向为神经元衰老、自由基生物医学、细胞凋亡与心血管疾病及其分子机制的研究。E-mail:peifli@qdu.edu.cn
癌症的发病率和死亡率逐年上升[1],已严重影响到人们的身体健康,目前还没有行之有效的治愈方式[2]。胃癌常发生于胃肠道系统中,是世界上最常见的六种恶性肿瘤之一,死亡率位列第二,仅排在肺癌之后[3-4]。胃癌组织中发现了许多异常表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)[5],并与癌细胞的增殖和转移密切相关[6]。人类基因组中有关蛋白质编码的基因约20 000 个,但仅占总基因组的2%[7],而大多数其他基因被转录生成非编码RNA(ncRNA)[8]。lncRNA是ncRNA中一个独立的分支,是一种非蛋白质编码RNA[9],长度超过200 个核苷酸[10]。……